类法尼醇x受体

核受体第一亚族H集团第四成员

有效结构

直系同源检索：PDBe, RCSB

PDB查询代码列表
1osh, 1osv, 1ot7

标识

代号

NR1H4; BAR; FXR; HRR-1; HRR1; MGC163445; RIP14

扩展标识

遗传学：603826 鼠基因：1352464 同源基因：3760 IUPHAR: GeneCards: NR1H4 Gene

基因本体论描述
分子功能	· 转录因子 · 类固醇激素受体 · 转录辅激活物 · 转录辅阻遏物 · 蛋白质结合 · 锌离子结合 · sequence-specific DNA binding · 金属离子结合
细胞成分	· 细胞核
生物过程	· 转录 · 依赖DNA的转运调控 · 信号转运 · 胆汁酸新陈代谢过程
Sources: Amigo / QuickGO

RNA表达模式

更多表达数据

直系同源体

物种

人类

小鼠

Entrez

9971

20186

Ensembl

ENSG00000012504

ENSMUSG00000047638

UniProt

Q96RI1

Q60641

mRNA序列

NM_005123

NM_009108

蛋白序列

NP_005114

NP_033134

基因位置

Chr 12:
99.39 – 99.48 Mb

Chr 10:
88.92 – 89 Mb

PubMed查询

[1]

[2]

类法尼醇x受体（Farnesoid X receptor）是核受体超家族的一员，它主要表达在肠道系统之中，参与胆汁酸代谢与胆固醇代谢等重要环节。在自然环境中其配体包括初级胆汁酸鹅脱氧胆酸、次级胆酸石胆酸、脱氧胆酸等。而人工合成物6-ECDCA、GW406等的结合性超过了天然配体。^[1]

来源

^ 法尼酯衍生物x受体与肝纤维化^{[永久失效連結]}

转录因子与细胞内受体

（1）碱性结构域

（1.1）碱性亮氨酸拉链（bZIP（英语：bZIP domain））	转录激活因子（英语：Activating transcription factor）（AATF（英语：Apoptosis-antagonizing transcription factor）、1、2、3、4、5、6、7） · AP-1（c-Fos、FOSB、FOSL1、FOSL2、c-Jun、JUNB、JUND） · BACH（1、2） · BATF · BLZF1 · C/EBP（α、β、γ、δ、ε、ζ） · CREB（1、3、L1） · CREM · DBP · DDIT3 · GABPA · Gcn4 · HLF · MAF（B、F、G、K） · NFE（2、L1、L2、L3） · NFIL3 · NRL · NRF（1、2、3） · XBP1

（1.2）碱性螺旋-环-螺旋（bHLH）	ATOH1 · AhR · AHRR · ARNT · ASCL1 · BHLHB2 · BMAL（ARNTL、ARNTL2） · CLOCK · EPAS1 · HAND（1、2） · HES（5、6） · HEY（1、2、L） · HES1 · HIF（1A、3A） · ID（1、2、3、4） · LYL1 · MXD4 · MYCL1 · MYCN · Neurogenins（1、2、3 · 肌形成调节因子（英语：Myogenic regulatory factors）（MyoD、成肌蛋白、MYF5、MYF6） · NeuroD（1、2） · NPAS（1、2、3） · OLIG（1、2） · Pho4 · Scleraxis · TAL（1、2） · Twist · USF1

（1.3）bHLH-ZIP（英语：Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factors）	AP-4 · MAX · MITF · MNT · MLX · MXI1 · Myc · SREBP（1、2）

（1.4） NF-1	NFI（A、B、C、X） · SMAD（R-SMAD（1、2、3、5、9） - I-SMAD（6、7） - 4）

（1.5） RF-X	RFX（1、2、3、4、5、ANK）

（1.6）碱性螺旋-跨-螺旋（英语：Basic helix-span-helix）（bHSH）	AP-2（α、β、γ、δ、ε）

（2）锌指结构DNA作用区域

（2.1）核受体（Cys₄）	第一亚族：甲状腺激素受体（α、β）、CAR、FXR、LXR（α、β）、PPAR（α（英语：Peroxisome proliferator-activated receptor alpha）、β/δ、γ）、PXR、RAR（α、β、γ）、ROR（α、β、γ）、 Rev-ErbA（α、β）、VDR 第二亚族（COUP-TF（I、II）、Ear-2（英语：V-erbA-related gene）、HNF4（英语：Hepatocyte nuclear factor 4）（α、γ）、PNR、RXR（α、β、γ）、Testicular receptor（2、4）、TLX）第三亚族（甾类激素（英语：Steroid hormone receptor）（雄激素、雌激素（α、β）、糖皮质激素、盐皮质激素、孕酮）、雌激素相关（英语：Estrogen related receptor）（α、β、γ））第四亚族NUR（英语：Nur (biology)）（NGFIB、NOR1、NURR1） · 第五亚族LRH-1、SF1 · 第六亚族GCNF（英语：Germ cell nuclear factor） · 第零亚族DAX1、SHP（英语：Small heterodimer partner）

（2.2）其他的Cys₄结构	GATA（英语：GATA transcription factor）（1、2、3、4、5、6） · MTA（1、2、3） · TRPS1（英语：Tricho-rhino-phalangeal syndrome Type 1）

（2.3） Cys₂His₂	通用转录因子（TFⅡA、TFⅡB、TFIID、TFⅡE、TFⅡF（1、2）、TFⅡH（1、2、4、2I、3A、3C1、3C2）） ATBF1 · BCL（6、11A、11B） · CTCF · E4F1 · EGR（1、2、3、4） · ERV3 · GFI1 · GLI-Krüppel family（1、2、3、REST、S2、YY1） · HIC（1、2） · HIVEP（1、2、3） · IKZF（1、2、3） · ILF（2、3） · Sp/KLF家族（KLF：1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、17，SP：1、2、4、7、8） · MTF1 · MYT1 · OSR1 · · WT1 · Zbtb7（7A、7B） · ZBTB（16、17、20、32、33、40） · zinc finger（3、7、9、10、19、22、24、33B、 34、35、41、43、44、51、74、143、146、148、165、202、217、219、238、239、259、267、268、281、295、318、330、346、350、365、366、384、 423、451、452、471、593、638、649、655）

（2.4） Cys₆	HIVEP1

（2.5）交替composition	AIRE · DIDO1 · GRLF1 · ING（1、2、4） · JARID（1A、1B、1C、1D、2） · JMJD1B

（2.6）WRKY结构	WRKY转录因子家族（英语：WRKY transcription factor family）

（3）螺旋-转角-螺旋结构域

（3.1）同源异型域	ARX（英语：Aristaless related homeobox） · CDX（1、2） · CRX · CUTL1 · DBX（1、2） · DLX（3、4、5） · EMX2 · EN（1、2） · FHL（1、2、3） · HESX1 · HHEX · HLX · 同源框（A1、A2、A3、A4、A5、A7、A9、A10、A11、A13、B1、B2、B3、B4、B5、B6、B7、B8、B9、B13、C4、C5、C6、C8、C9、C10、C11、C13、D1、D3、D4、D8、D9、D10、D11、 D12、D13） · HOPX · IRX（1、2、3、4、5、6、MKX） · LMX（1A、1B） · MEIS（1、2） · MEOX2 · MNX1 · MSX（1、2） · NANOG · NKX（2-1、2-2、2-3、2-5、3-1、3-2、6-1、6-2） · PBX（1、2、3） · PHF（1、3、6、8、10、16、17、20、21A） · PITX（1、2、3） · POU结构域（PIT-1、BRN-3: A、B、C、八聚体转录因子：1、2、3/4、6、7、11） · OTX（1、2） · PDX1 · ZEB（1、2）

（3.2）配对框	PAX（1、2、3、4、5、6、7、8、9）

（3.3）叉头状/翼状螺旋	E2F（1、2、3、4、5） · FOX proteins（C1、C2、D3、E1、G1、H1、K2、L2、M1、N3、O1、O3、O4、P1、P2、P3）

（3.4）热休克因子（英语：Heat Shock Factor）	HSF（1、2、4）

（3.5）色氨酸簇（英语：Tryptophan clusters）	ELF（2、4、5） · EGF · ELK（1、3、4） · ERF · ERG · ETS（1、2、SPIB） · ETV（1、4、5、6） · FLI1 · Interferon regulatory factors（1、2、3、4、5、6、7、8） · MYB · MYBL2

（3.6）TEA结构域	transcriptional enhancer factor（1、2、3、4）

（4）具有小凹槽触点的β-支架因子

（4.1） Rel homology region（英语：Rel homology domain）	NF-κB（NFKB1、NFKB2、REL、RELA、RELB） · NFAT（C1、C2、C3、C4、5）

（4.2） STAT	STAT（1、2、3、4、5、6）

（4.3） p53样转录因子	p53 p63 p73家族（p53 · p63 · p73） · TBX（1、2、3、5、19、21、22、Brachyury、TBR1）

（4.4） MADS盒	Mef2（A、B、C、D） · SRF

（4.6） TATA结合蛋白	TATA结合蛋白 · TBPL1

（4.7）高迁移率族	BBX（英语：BBX (gene)） · HMGB（1（英语：HMGB1）、2（英语：HMGB2）、3（英语：HMGB3）、4（英语：HMGB4）） · HMGN（英语：HMGN）、（1（英语：HMGN1）、2（英语：HMGN2）、3（英语：HMGN3）、4（英语：HMGN4）） · HNF（1A、1B） · SOX（1、2、3、4、5、6、8、9、10、11、12、13、14、15、18、21、SRY） · SSRP1 · TCF/LEF家族（TCF（1、3、4） · LEF1) · TOX（1、2、3、4）

（4.9） Grainyhead（英语：Grainyhead）	TFCP2

（4.10）冷休克域（英语：Cold-shock domain）	CSDA、YBX1

（4.11） Runt	CBF（CBFA2T2、CBFA2T3、RUNX1、RUNX2、RUNX3、RUNX1T1）

（0）其他转录因子

（0.2） HMGI（Y）	HMGA（1、2） · HBP1

（0.3）袋状结构域	Rb · RBL1（英语：Retinoblastoma-like protein 1） · RBL2（英语：Retinoblastoma-like protein 2）

（0.5） AP-2/EREBP-related factors	Apetala 2 · EREBP（英语：Ethylene-responsive element binding protein） · B3(ARF · ABI3 · RAV)

（0.6） Miscellaneous	ARID（1A、1B、2、3A、3B、4A） · CAP · IFI（16、35） · MLL（2、3、T1） · MNDA · NFY（A、B、C） · ρ因子/σ因子