Sp8轉錄因子

Sp8轉錄因子
識別號
别名SP8;, BTD, Sp8 transcription factor
外部IDOMIM:608306 MGI:2443471 HomoloGene:18548 GeneCards:SP8
基因位置(人类
7號染色體
染色体7號染色體[1]
7號染色體
Sp8轉錄因子的基因位置
Sp8轉錄因子的基因位置
基因座7p21.1起始20,782,279 bp[1]
终止20,786,886 bp[1]
基因位置(小鼠
小鼠12号染色体
染色体小鼠12号染色体[2]
小鼠12号染色体
Sp8轉錄因子的基因位置
Sp8轉錄因子的基因位置
基因座12|12 F2起始118,810,064 bp[2]
终止118,816,311 bp[2]
基因本體
分子功能 DNA结合
金屬離子結合
nucleic acid binding
DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
細胞組分 细胞核
生物學過程 proximal/distal pattern formation
regulation of transcription, DNA-templated
dorsal/ventral pattern formation
embryonic limb morphogenesis
transcription, DNA-templated
regulation of transcription by RNA polymerase II
Sources:Amigo / QuickGO
直系同源
物種人類小鼠
Entrez

221833

320145

Ensembl

ENSG00000164651

ENSMUSG00000048562

UniProt

Q8IXZ3

Q8BMJ8

mRNA​序列

NM_182700
​NM_198956

NM_177082
​NM_001379379
​NM_001379380

蛋白序列

NP_874359
​NP_945194

NP_796056
​NP_001366308
​NP_001366309

基因位置​(UCSC)Chr 7: 20.78 – 20.79 MbChr 12: 118.81 – 118.82 Mb
PubMed​查找[3][4]
維基數據
檢視/編輯人類檢視/編輯小鼠

Sp8轉錄因子又稱為特異性蛋白8(specificity protein 8、SP-8)或Btd轉錄因子[5]是由SP8基因編碼的人類蛋白質[6][7],位於人類的7號染色體中。Sp8是Sp/KLF家族轉錄因子

功能

Sp8在肢體生長早起扮演了協調的作用。[5]在小鼠實驗中,若小鼠缺失Sp8基因會導致嚴重的腦外畸形英语Exencephaly[8]

參考文獻

  1. ^ 1.0 1.1 1.2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000164651 - Ensembl, May 2017
  2. ^ 2.0 2.1 2.2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000048562 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  4. ^ Mouse PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  5. ^ 5.0 5.1 Treichel D, Schöck F, Jäckle H, Gruss P, Mansouri A. mBtd is required to maintain signaling during murine limb development (PDF). Genes & Development. November 2003, 17 (21): 2630–5 [2024-01-28]. PMC 280612可免费查阅. PMID 14597661. doi:10.1101/gad.274103. (原始内容存档 (PDF)于2017-09-22). 
  6. ^ Bell SM, Schreiner CM, Waclaw RR, Campbell K, Potter SS, Scott WJ. Sp8 is crucial for limb outgrowth and neuropore closure. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. October 2003, 100 (21): 12195–200. PMC 218735可免费查阅. PMID 14526104. doi:10.1073/pnas.2134310100可免费查阅. 
  7. ^ Entrez Gene: Sp8 transcription factor. 
  8. ^ Waclaw RR, Allen ZJ, Bell SM, Erdélyi F, Szabó G, Potter SS, Campbell K. The zinc finger transcription factor Sp8 regulates the generation and diversity of olfactory bulb interneurons. Neuron. February 2006, 49 (4): 503–16. PMID 16476661. S2CID 17734218. doi:10.1016/j.neuron.2006.01.018可免费查阅. 

延伸閱讀

  • Lee MT, Chen CH, Lee CS, Chen CC, Chong MY, Ouyang WC, Chiu NY, Chuo LJ, Chen CY, Tan HK, Lane HY, Chang TJ, Lin CH, Jou SH, Hou YM, Feng J, Lai TJ, Tung CL, Chen TJ, Chang CJ, Lung FW, Chen CK, Shiah IS, Liu CY, Teng PR, Chen KH, Shen LJ, Cheng CS, Chang TP, Li CF, Chou CH, Chen CY, Wang KH, Fann CS, Wu JY, Chen YT, Cheng AT. Genome-wide association study of bipolar I disorder in the Han Chinese population. Molecular Psychiatry. May 2011, 16 (5): 548–56. PMID 20386566. S2CID 41746496. doi:10.1038/mp.2010.43.  温哥华格式错误 (帮助)
  • Milona MA, Gough JE, Edgar AJ. Genomic structure and cloning of two transcript isoforms of human Sp8. BMC Genomics. November 2004, 5: 86. PMC 534095可免费查阅. PMID 15533246. doi:10.1186/1471-2164-5-86可免费查阅. 
  • Jugessur A, Shi M, Gjessing HK, Lie RT, Wilcox AJ, Weinberg CR, Christensen K, Boyles AL, Daack-Hirsch S, Nguyen TT, Christiansen L, Lidral AC, Murray JC. Maternal genes and facial clefts in offspring: a comprehensive search for genetic associations in two population-based cleft studies from Scandinavia. PLOS ONE. July 2010, 5 (7): e11493. Bibcode:2010PLoSO...511493J. PMC 2901336可免费查阅. PMID 20634891. doi:10.1371/journal.pone.0011493可免费查阅.  温哥华格式错误 (帮助)
  • Barber MJ, Mangravite LM, Hyde CL, Chasman DI, Smith JD, McCarty CA, Li X, Wilke RA, Rieder MJ, Williams PT, Ridker PM, Chatterjee A, Rotter JI, Nickerson DA, Stephens M, Krauss RM. Genome-wide association of lipid-lowering response to statins in combined study populations. PLOS ONE. March 2010, 5 (3): e9763. Bibcode:2010PLoSO...5.9763B. PMC 2842298可免费查阅. PMID 20339536. doi:10.1371/journal.pone.0009763可免费查阅. 
  • Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T, Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S. Diversification of transcriptional modulation: large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes. Genome Research. January 2006, 16 (1): 55–65. PMC 1356129可免费查阅. PMID 16344560. doi:10.1101/gr.4039406. 
  • Ravasi T, Suzuki H, Cannistraci CV, Katayama S, Bajic VB, Tan K, Akalin A, Schmeier S, Kanamori-Katayama M, Bertin N, Carninci P, Daub CO, Forrest AR, Gough J, Grimmond S, Han JH, Hashimoto T, Hide W, Hofmann O, Kamburov A, Kaur M, Kawaji H, Kubosaki A, Lassmann T, van Nimwegen E, MacPherson CR, Ogawa C, Radovanovic A, Schwartz A, Teasdale RD, Tegnér J, Lenhard B, Teichmann SA, Arakawa T, Ninomiya N, Murakami K, Tagami M, Fukuda S, Imamura K, Kai C, Ishihara R, Kitazume Y, Kawai J, Hume DA, Ideker T, Hayashizaki Y. An atlas of combinatorial transcriptional regulation in mouse and man. Cell. March 2010, 140 (5): 744–52. PMC 2836267可免费查阅. PMID 20211142. doi:10.1016/j.cell.2010.01.044. 
 
(1) 碱性结构域
(1.1)碱性亮氨酸拉链
bZIP英语bZIP domain
转录激活因子英语Activating transcription factorAATF英语Apoptosis-antagonizing transcription factor1、2、3、4、5、6、7) · AP-1(c-Fos、FOSB、FOSL1、FOSL2、c-Jun、JUNB、JUND) · BACH(1、2) · BATF · BLZF1 ·
C/EBPαβγδ、ε、ζ) · CREB(1、3、L1) · CREM · DBP · DDIT3 · GABPA · Gcn4 · HLF · MAF(B、F、G、K) ·
NFE(2、L1、L2、L3) · NFIL3 · NRL · NRF(1、2、3) · XBP1
(1.2)碱性螺旋-环-螺旋
bHLH
ATOH1 · AhR · AHRR · ARNT · ASCL1 · BHLHB2 · BMAL(ARNTL、ARNTL2) · CLOCK · EPAS1 · HAND(1、2) · HES(5、6) ·
HEY(1、2、L) · HES1 · HIF(1A、3A) · ID(1、2、3、4) · LYL1 · MXD4 · MYCL1 · MYCN · Neurogenins(1、2、3 ·
肌形成调节因子英语Myogenic regulatory factors(MyoD、成肌蛋白、MYF5、MYF6) · NeuroD(1、2) · NPAS(1、2、3) · OLIG(1、2) · Pho4 ·
Scleraxis · TAL(1、2) · Twist · USF1
(1.3)bHLH-ZIP英语Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factors
AP-4 · MAX · MITF · MNT · MLX · MXI1 · Myc · SREBP(1、2)
(1.4) NF-1
NFI(A、B、C、X) · SMAD(R-SMAD(1、2、3、5、9) - I-SMAD(6、7) - 4)
(1.5) RF-X
RFX(1、2、3、4、5、ANK)
(1.6)碱性螺旋-跨-螺旋英语Basic helix-span-helix
(bHSH)
AP-2(α、β、γ、δ、ε)
 
(2) 锌指结构DNA作用区域
(2.1) 核受体Cys4
第一亚族:甲状腺激素受体αβ)、CAR、FXRLXR(α、β)、PPARα英语Peroxisome proliferator-activated receptor alpha、β/δ、γ)、PXR、RAR(α、β、γ)、ROR(α、β、γ)、
Rev-ErbA(α、β)、VDR
第二亚族(COUP-TF(I、II)、Ear-2英语V-erbA-related geneHNF4英语Hepatocyte nuclear factor 4(α、γ)、PNR、RXR(α、β、γ)、Testicular receptor(2、4)、TLX)
第三亚族(甾类激素英语Steroid hormone receptor雄激素、雌激素(α、β)、糖皮质激素、盐皮质激素、孕酮)、雌激素相关英语Estrogen related receptor(α、β、γ))
第四亚族NUR英语Nur (biology)(NGFIB、NOR1、NURR1) · 第五亚族LRH-1、SF1 · 第六亚族GCNF英语Germ cell nuclear factor · 第零亚族DAX1、SHP英语Small heterodimer partner
(2.2) 其他的Cys4结构
GATA英语GATA transcription factor(1、2、3、4、5、6) · MTA(1、2、3) · TRPS1英语Tricho-rhino-phalangeal syndrome Type 1
(2.3) Cys2His2
通用转录因子(TFⅡA、TFⅡB、TFIID、TFⅡE、TFⅡF(1、2)、TFⅡH(1、2、4、2I、3A、3C1、3C2))
ATBF1 · BCL(6、11A、11B) · CTCF · E4F1 · EGR(1、234 · ERV3 · GFI1 · GLI-Krüppel family(1、2、3、REST、S2、YY1) ·
HIC(1、2) · HIVEP(1、2、3) · IKZF(1、2、3) · ILF(2、3) · Sp/KLF家族KLF:1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、17,SP:1、2、4、7、8) · MTF1 · MYT1 ·
OSR1 ·  · WT1 · Zbtb7(7A、7B) · ZBTB(16、17、20、32、33、40) · zinc finger(3、7、9、10、19、22、24、33B、
34、35、41、43、44、51、74、143、146、148、165、202、217、219、238、239、259、267、268、281、295、318、330、346、350、365、366、384、
423、451、452、471、593、638、649、655)
(2.4) Cys6
HIVEP1
(2.5)交替composition
AIRE · DIDO1 · GRLF1 · ING(1、2、4) · JARID(1A、1B、1C、1D、2) · JMJD1B
(2.6)WRKY结构
WRKY转录因子家族英语WRKY transcription factor family
 
(3)螺旋-转角-螺旋结构域
ARX英语Aristaless related homeobox · CDX1、2) · CRX · CUTL1 · DBX(1、2)  · DLX(3、4、5) · EMX2 · EN(1、2) · FHL(1、2、3) · HESX1 · HHEX · HLX · 同源框(A1、A2、A3、A4、A5、A7、A9、A10、A11、A13、B1、B2、B3、B4、B5、B6、B7、B8、B9、B13、C4、C5、C6、C8、C9、C10、C11、C13、D1、D3、D4、D8、D9、D10、D11、
D12、D13) · HOPX · IRX(1、2、3、4、5、6、MKX) · LMX(1A、1B) · MEIS(1、2) · MEOX2 · MNX1 · MSX1、2) · NANOG · NKX(2-1、2-2、2-3、2-5、3-1、3-2、6-1、6-2) · PBX(1、2、3) · PHF(1、3、6、8、10、16、17、20、21A) · PITX(1、2、3) · POU结构域(PIT-1、BRN-3: A、B、C、八聚体转录因子:1、2、3/4、6、7、11) · OTX(1、2) · PDX1 · ZEB1、2)
(3.2)配对框
PAX(1、2、3、4、5、6、7、8、9)
(3.3)叉头状/翼状螺旋
E2F1、2、3、4、5) · FOX proteins(C1、C2、D3、E1、G1、H1、K2、L2、M1、N3、O1、O3、O4、P1、P2P3
(3.4)热休克因子英语Heat Shock Factor
HSF(1、2、4)
(3.5)色氨酸簇英语Tryptophan clusters
ELF(2、4、5) · EGF · ELK(1、3、4) · ERF · ERG · ETS(1、2、SPIB) · ETV(1、4、5、6) · FLI1 · Interferon regulatory factors(1、2、3、4、5、6、7、8) · MYB · MYBL2
(3.6)TEA结构域
transcriptional enhancer factor(1、2、3、4)
 
(4) 具有小凹槽触点的β-支架因子
(4.1) Rel homology region英语Rel homology domain
NF-κB(NFKB1、NFKB2、REL、RELA、RELB) · NFAT(C1、C2、C3、C4、5)
(4.2) STAT
STAT1234、5、6
(4.3) p53样转录因子
p53 p63 p73家族p53 · p63 · p73 · TBX(1、2、3、5、19、21、22、Brachyury、TBR1)
(4.4) MADS盒
Mef2(A、B、C、D) · SRF
(4.7) 高迁移率族
BBX英语BBX (gene) · HMGB1英语HMGB12英语HMGB23英语HMGB34英语HMGB4 · HMGN英语HMGN、(1英语HMGN12英语HMGN23英语HMGN34英语HMGN4 · HNF(1A、1B) · SOX(1、2、3、4、5、6、8、9、10、11、12、13、14、15、18、21、SRY · SSRP1 ·
TCF/LEF家族TCF(1、3、4) · LEF1) · TOX(1、2、3、4)
(4.9) Grainyhead英语Grainyhead
TFCP2
(4.10) 冷休克域英语Cold-shock domain
CSDA、YBX1
(4.11) Runt
CBF(CBFA2T2、CBFA2T3、RUNX1、RUNX2、RUNX3、RUNX1T1)
 
(0) 其他转录因子
(0.2) HMGI(Y)
HMGA(1、2) · HBP1
(0.3) 袋状结构域
Rb · RBL1英语Retinoblastoma-like protein 1 · RBL2英语Retinoblastoma-like protein 2
(0.5) AP-2/EREBP-related factors
Apetala 2 · EREBP英语Ethylene-responsive element binding protein · B3(ARF · ABI3 · RAV)
(0.6) Miscellaneous
ARID(1A、1B、2、3A、3B、4A) · CAP · IFI(16、35) · MLL(2、3、T1) · MNDA · NFY(A、B、C) · ρ因子/σ因子
参见 转录因子/共调节因子缺陷英语Template:Transcription factor/coregulator deficiencies
Category:蛋白质生物合成模板