TMOD1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4PKG, 4PKH, 4PKI, 4Z8G, 4Z94

Ідентифікатори

Символи

TMOD1, D9S57E, ETMOD, TMOD, tropomodulin 1

Зовнішні ІД

OMIM: 190930 MGI: 98775 HomoloGene: 20701 GeneCards: TMOD1

Пов'язані генетичні захворювання

ожиріння^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• actin filament binding • actin binding • tropomyosin binding
Клітинна компонента	• мембрана • COP9 signalosome • цитоскелет • гіалоплазма • cortical cytoskeleton • цитоплазма • саркомера • міофібрила • мікрофіламент • striated muscle thin filament
Біологічний процес	• adult locomotory behavior • lens fiber cell development • muscle filament sliding • pointed-end actin filament capping • м'язове скорочення • actin filament organization • myofibril assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7111


21916

Ensembl


н/д


ENSMUSG00000028328

UniProt


P28289


P49813

RefSeq (мРНК)


NM_003275 NM_001166116


NM_021883

RefSeq (білок)


NP_001159588 NP_003266


NP_068683

Локус (UCSC)

н/д

Хр. 4: 46.04 – 46.12 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TMOD1 (англ. Tropomodulin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 359 амінокислот, а молекулярна маса — 40 569^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSYRRELEKY	RDLDEDEILG	ALTEEELRTL	ENELDELDPD	NALLPAGLRQ
KDQTTKAPTG	PFKREELLDH	LEKQAKEFKD	REDLVPYTGE	KRGKVWVPKQ
KPLDPVLESV	TLEPELEEAL	ANASDAELCD	IAAILGMHTL	MSNQQYYQAL
SSSSIMNKEG	LNSVIKPTQY	KPVPDEEPNS	TDVEETLERI	KNNDPKLEEV
NLNNIRNIPI	PTLKAYAEAL	KENSYVKKFS	IVGTRSNDPV	AYALAEMLKE
NKVLKTLNVE	SNFISGAGIL	RLVEALPYNT	SLVEMKIDNQ	SQPLGNKVEM
EIVSMLEKNA	TLLKFGYHFT	QQGPRLRASN	AMMNNNDLVR	KRRLADLTGP
IIPKCRSGV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

Chu X., Thompson D., Yee L.J., Sung L.A. (2000). Genomic organization of mouse and human erythrocyte tropomodulin genes encoding the pointed end capping protein for the actin filaments. Gene. 256: 271—281. PMID 11054557 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00327-9
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Sung L.A., Lin J.J.-C. (1994). Erythrocyte tropomodulin binds to the N-terminus of hTM5, a tropomyosin isoform encoded by the gamma-tropomyosin gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 201: 627—634. PMID 8002995 DOI:10.1006/bbrc.1994.1747

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TMOD1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11871 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, P28289 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Білки цитоскелету

Людські

Мікрофіламенти
та актин-зв'язуючі білки

Міофіламенти

Актин	A1 A2 B C1 G1 G2

Міозин	I A B C D E F G H II 1 2 3 4 6 7 7B 8 9 10 11 13 14 15 16 III A B V A B C VI MYO6 VII A B IX A B X MYO10 XV A B XVIII A B Легкий ланцюг міозину 1 2 3 4 5 6 6B 7 9 10 12A 12B IP K K2 K3 K4 L1 PF

Інші	Тропомодулін 1 2 3 4 Тропонін T 1 2 3 C 1 2 I 1 2 3 Тропоміозин 1 2 3 4 Актинін 1 2 3 4 Комплекс Arp2/3 актин-деполімеризуючі фактори Кофілін 1 2 дестрин Гелсолін Профілін 1 2 Тітин

Інші

WAS
Фібрилін
Філамін
- A
- B
- C
Еспін
TRIOBP

Проміжні філаменти

Тип 1/2
(Кератин,
Цитокератин)

Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини)	тип I/хромосома 17 10 12 13 14 15 16 17 19 20 хромосома 12 18 інші 21 тип II/хромосома 12 1 2 3 4 5 6A 6B 7 8 9

Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини)	тип I/хромосома 17 31 32 33A 33B 34 35 36 37 38 тип II/хромосома 12 81 82 83 84 85 86

Незгруповані альфа	хромосома 17 23 24 25 26 27 28 39 40 хромосома 12 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80

Не-альфа	Бета-кератин

Тип 3

Тип 4

Інтернексин
Нестин
Нейрофіламент
- NEFL
- NEFM
- NEFH
Синемін
Синкоїлін

Тип 5

Ламіни: A/C
B1
B2

Мікротрубочки
та пов'язані білки

Тубулін	1A 1B 1C 3C 3D 3E 4A 8

Кінезин	1A 1B 2A 2C 3B 3C 4A 4B 5A 5B 5C 6 7 9 11 12 13A 13B 14 15 16B 17 18A 18B 19 20A 20B 21A 21B 22 23 24 25 26A 26B 27 C1 C2 C3

Динеїн	аксонемні: 1 2 3 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 17 I1 I2 LI1 L1 L4 цитоплазматичні: C1H1 C2H1 C1I1 C1I2 C1LI1 C1LI2 C2LI1 LL1 LL2 LRB1 LRB2 LT1 LT3

Інші	MAPT DCTN1 STMN1 Тектин 1 2 3 4 5 Динамін 1 2 3