TRPV1

Ідентифікатори

Символи

TRPV1, VR1, transient receptor potential cation channel subfamily V member 1

Зовнішні ІД

OMIM: 602076 MGI: 1341787 HomoloGene: 12920 GeneCards: TRPV1

Реагує на сполуку

Анандамід, капсаїцин, piperine, 5S-HETE, Камфора, гідрон, capsazepine, 2-aminoethoxydiphenylborate, 5'-iodoresiniferatoxin, Аліцин, NADA, amg-517, AZD1386, SB-705498^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • ion channel activity • phosphoprotein binding • ATP binding • cation transmembrane transporter activity • cation channel activity • ligand-gated ion channel activity • calcium-release channel activity • temperature-gated ion channel activity • identical protein binding • chloride channel regulator activity • transmembrane signaling receptor activity • excitatory extracellular ligand-gated ion channel activity • calcium channel activity • extracellular ligand-gated ion channel activity • phosphatidylinositol binding • зв'язування з іоном металу • calmodulin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • postsynaptic membrane • cell projection • мембрана • клітинна мембрана • синапс • міжклітинні контакти • dendritic spine membrane • гіалоплазма • neuronal cell body • intrinsic component of plasma membrane • дендрит (нейробіологія) • external side of plasma membrane • neuron projection • integral component of plasma membrane • мітохондрія
Біологічний процес	• ion transport • chemosensory behavior • cell surface receptor signaling pathway • calcium ion transmembrane transport • thermoception • calcium ion transport • inflammatory response • трансмембранний транспорт • release of sequestered calcium ion into cytosol • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • diet induced thermogenesis • detection of chemical stimulus involved in sensory perception of pain • microglial cell activation • cellular response to growth factor stimulus • positive regulation of gastric acid secretion • response to peptide hormone • cellular response to nerve growth factor stimulus • positive regulation of nitric oxide biosynthetic process • negative regulation of establishment of blood-brain barrier • lipid metabolism • temperature homeostasis • response to heat • cellular response to temperature stimulus • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • peptide secretion • detection of temperature stimulus involved in sensory perception of pain • sensory perception of mechanical stimulus • smooth muscle contraction involved in micturition • behavioral response to pain • response to pain • cellular response to alkaloid • cellular response to cytokine stimulus • fever generation • detection of temperature stimulus involved in thermoception • positive regulation of apoptotic process • urinary bladder smooth muscle contraction • glutamate secretion • sensory perception of pain • cellular response to tumor necrosis factor • cellular response to ATP • ion transmembrane transport • response to pH • response to organonitrogen compound • cellular response to heat • protein homotetramerization • excitatory postsynaptic potential • cellular response to acidic pH • response to capsazepine • calcium ion import across plasma membrane • negative regulation of systemic arterial blood pressure • negative regulation of heart rate • negative regulation of mitochondrial membrane potential
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7442


193034

Ensembl


ENSG00000196689


ENSMUSG00000005952

UniProt


Q8NER1


Q704Y3

RefSeq (мРНК)


NM_018727 NM_080704 NM_080705 NM_080706


NM_001001445

RefSeq (білок)


NP_061197 NP_542435 NP_542436 NP_542437


NP_001001445

Локус (UCSC)

Хр. 17: 3.57 – 3.61 Mb

Хр. 11: 73.13 – 73.15 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRPV1 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1) – білок, який кодується однойменним геном TRPV1, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 839 амінокислот, а молекулярна маса — 94 956 Da^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKKWSSTDLG	AAADPLQKDT	CPDPLDGDPN	SRPPPAKPQL	STAKSRTRLF
GKGDSEEAFP	VDCPHEEGEL	DSCPTITVSP	VITIQRPGDG	PTGARLLSQD
SVAASTEKTL	RLYDRRSIFE	AVAQNNCQDL	ESLLLFLQKS	KKHLTDNEFK
DPETGKTCLL	KAMLNLHDGQ	NTTIPLLLEI	ARQTDSLKEL	VNASYTDSYY
KGQTALHIAI	ERRNMALVTL	LVENGADVQA	AAHGDFFKKT	KGRPGFYFGE
LPLSLAACTN	QLGIVKFLLQ	NSWQTADISA	RDSVGNTVLH	ALVEVADNTA
DNTKFVTSMY	NEILMLGAKL	HPTLKLEELT	NKKGMTPLAL	AAGTGKIGVL
AYILQREIQE	PECRHLSRKF	TEWAYGPVHS	SLYDLSCIDT	CEKNSVLEVI
AYSSSETPNR	HDMLLVEPLN	RLLQDKWDRF	VKRIFYFNFL	VYCLYMIIFT
MAAYYRPVDG	LPPFKMEKTG	DYFRVTGEIL	SVLGGVYFFF	RGIQYFLQRR
PSMKTLFVDS	YSEMLFFLQS	LFMLATVVLY	FSHLKEYVAS	MVFSLALGWT
NMLYYTRGFQ	QMGIYAVMIE	KMILRDLCRF	MFVYIVFLFG	FSTAVVTLIE
DGKNDSLPSE	STSHRWRGPA	CRPPDSSYNS	LYSTCLELFK	FTIGMGDLEF
TENYDFKAVF	IILLLAYVIL	TYILLLNMLI	ALMGETVNKI	AQESKNIWKL
QRAITILDTE	KSFLKCMRKA	FRSGKLLQVG	YTPDGKDDYR	WCFRVDEVNW
TTWNTNVGII	NEDPGNCEGV	KRTLSFSLRS	SRVSGRHWKN	FALVPLLREA
SARDRQSAQP	EEVYLRQFSG	SLKPEDAEVF	KSPAASGEK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

TRPV1 - це неселективний катіонний канал та належить до іонних каналів, який активується:

протонами,
ванілоїдними сполуками - капсаїцином (CAP),
резініфератоксином (RTX),
ліпідами, що надходять з мембран, включаючи анандамід (Caterina et al., 1997 [Архівовано 3 грудня 2020 у Wayback Machine.]; Caterina and Julius, 2001) [Архівовано 20 січня 2021 у Wayback Machine.].

Капсаїцин є найбільш потужним і специфічним відомим агоністом TRPV1.

Функції білка TRPV1

TRPV1 задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою кальмодуліну, іонами металів, іоном кальцію. Цей рецептор також активується підвищенням температури в шкідливому діапазоні, тож можливо, що він функціонує як перетворювач болючих теплових подразників in vivo.^[6]

Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.

Експресія гена TRPV1

Цей ген має 10 транскриптів (сплайс варіантів), 197 ортологів та 5 паралогів. ^[7]

Експресія TRPV1, в ЦНС, має важливе значення для потенційних побічних ефектів агоністів і антагоністів TRPV1, що розробляються для лікування хронічного болю.^[8]

Cavanaugh et al. (2011) [Архівовано 19 січня 2019 у Wayback Machine.] досліджували експресію TRPV1, використовуючи метод генного націлювання для модифікації генетичного локусу TRPV1. Була продемонстрована стійка експресія TRPV1 у первинних аферентних нейронах та виявлена у підмножині клітин гладких м’язів в тканинах, що виконують функцію терморегуляції.

Розлади, що пов'язані з TRPV1

Соматоформний розлад

Соматоформний розлад пов’язаний із тривогою та обсесивно-компульсивним розладом і має такі симптоми, як судоми, задишка та запаморочення. Важливим геном, асоційованим із соматоформним розладом, є TRPV1.^[9]

Синдром "палаючого рота"^[en]

Синдром печіння рота, також відомий як стоматодинія, пов’язаний з глоситом та хворобою Graft-versus-host disease^[en] , і має симптоми, включаючи пероральні прояви. Важливим геном, пов’язаним із синдромом, є TRPV1. ^[10]

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з TRPV1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12716 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
↑ UniProt, Q8NER1 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
↑ TRPV1 Gene - GeneCards | TRPV1 Protein | TRPV1 Antibody. www.genecards.org. Архів оригіналу за 25 січня 2021. Процитовано 23 грудня 2020.
↑ Gene: TRPV1 (ENSG00000196689) - Summary - Homo_sapiens - Ensembl genome browser 102. www.ensembl.org. Архів оригіналу за 9 червня 2019. Процитовано 23 грудня 2020.
↑ Cavanaugh, Daniel J.; Chesler, Alexander T.; Jackson, Alexander C.; Sigal, Yaron M.; Yamanaka, Hiroki; Grant, Rebecca; O'Donnell, Dajan; Nicoll, Roger A.; Shah, Nirao M. (30 березня 2011). Trpv1 Reporter Mice Reveal Highly Restricted Brain Distribution and Functional Expression in Arteriolar Smooth Muscle Cells. Journal of Neuroscience (англ.). Т. 31, № 13. с. 5067—5077. doi:10.1523/JNEUROSCI.6451-10.2011. ISSN 0270-6474. PMID 21451044. Архів оригіналу за 21 червня 2021. Процитовано 23 грудня 2020.
↑ Somatoform Disorder disease: Malacards - Research Articles, Drugs, Genes, Clinical Trials. www.malacards.org. Архів оригіналу за 14 червня 2021. Процитовано 23 грудня 2020.
↑ Burning Mouth Syndrome disease: Malacards - Research Articles, Drugs, Genes, Clinical Trials. www.malacards.org. Архів оригіналу за 11 травня 2021. Процитовано 23 грудня 2020.

Див. також

Хромосома 17

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані