HCN1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3U0Z

Ідентифікатори

Символи

HCN1, BCNG-1, BCNG1, EIEE24, HAC-2, hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1, GEFSP10, DEE24

Зовнішні ІД

OMIM: 602780 MGI: 1096392 HomoloGene: 32093 GeneCards: HCN1

Пов'язані генетичні захворювання

undetermined early-onset epileptic encephalopathy, generalized epilepsy with febrile seizures plus^[1]

Реагує на сполуку

івабрадин^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • intracellular cAMP-activated cation channel activity • identical protein binding • voltage-gated sodium channel activity • ion channel activity • potassium channel activity • sodium channel activity • voltage-gated ion channel activity • voltage-gated potassium channel activity • voltage-gated cation channel activity • cAMP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• аксон • мембрана • дендрит (нейробіологія) • клітинна мембрана • integral component of membrane • HCN channel complex • integral component of plasma membrane
Біологічний процес	• трансмембранний транспорт • retinal cone cell development • regulation of ion transmembrane transport • apical protein localization • ion transport • sodium ion transport • regulation of membrane potential • sodium ion transmembrane transport • potassium ion transmembrane transport • potassium ion transport • protein homotetramerization • cellular response to cAMP
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


348980


15165

Ensembl


ENSG00000164588


ENSMUSG00000021730

UniProt


O60741


O88704

RefSeq (мРНК)


NM_021072


NM_010408

RefSeq (білок)


NP_066550


NP_034538

Локус (UCSC)

Хр. 5: 45.25 – 45.7 Mb

Хр. 13: 117.74 – 118.12 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HCN1 (англ. Hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 890 амінокислот, а молекулярна маса — 98 796^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEGGGKPNSS	SNSRDDGNSV	FPAKASATGA	GPAAAEKRLG	TPPGGGGAGA
KEHGNSVCFK	VDGGGGGGGG	GGGGEEPAGG	FEDAEGPRRQ	YGFMQRQFTS
MLQPGVNKFS	LRMFGSQKAV	EKEQERVKTA	GFWIIHPYSD	FRFYWDLIML
IMMVGNLVII	PVGITFFTEQ	TTTPWIIFNV	ASDTVFLLDL	IMNFRTGTVN
EDSSEIILDP	KVIKMNYLKS	WFVVDFISSI	PVDYIFLIVE	KGMDSEVYKT
ARALRIVRFT	KILSLLRLLR	LSRLIRYIHQ	WEEIFHMTYD	LASAVVRIFN
LIGMMLLLCH	WDGCLQFLVP	LLQDFPPDCW	VSLNEMVNDS	WGKQYSYALF
KAMSHMLCIG	YGAQAPVSMS	DLWITMLSMI	VGATCYAMFV	GHATALIQSL
DSSRRQYQEK	YKQVEQYMSF	HKLPADMRQK	IHDYYEHRYQ	GKIFDEENIL
NELNDPLREE	IVNFNCRKLV	ATMPLFANAD	PNFVTAMLSK	LRFEVFQPGD
YIIREGAVGK	KMYFIQHGVA	GVITKSSKEM	KLTDGSYFGE	ICLLTKGRRT
ASVRADTYCR	LYSLSVDNFN	EVLEEYPMMR	RAFETVAIDR	LDRIGKKNSI
LLQKFQKDLN	TGVFNNQENE	ILKQIVKHDR	EMVQAIAPIN	YPQMTTLNST
SSTTTPTSRM	RTQSPPVYTA	TSLSHSNLHS	PSPSTQTPQP	SAILSPCSYT
TAVCSPPVQS	PLAARTFHYA	SPTASQLSLM	QQQPQQQVQQ	SQPPQTQPQQ
PSPQPQTPGS	STPKNEVHKS	TQALHNTNLT	REVRPLSASQ	PSLPHEVSTL
ISRPHPTVGE	SLASIPQPVT	AVPGTGLQAG	GRSTVPQRVT	LFRQMSSGAI
PPNRGVPPAP	PPPAAALPRE	SSSVLNTDPD	AEKPRFASNL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, транспорт натрію. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, калію, іоном натрію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Lee C.H., MacKinnon R. (2017). Structures of the human HCN1 hyperpolarization-activated channel. Cell. 168: 111—120. PMID 28086084 DOI:10.1016/j.cell.2016.12.023

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з HCN1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4845 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, O60741 (англ.) . Архів оригіналу за 16 жовтня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані