RPS18

RPS18
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 4KZY, 3J7R, 4D61, 4KZX, 4D5L, 4V5Z, 5FLX, 4UJD, 3J7P, 4KZZ, 4UJE, 4UJC

Ідентифікатори
Символи RPS18, D6S218E, HKE3, KE-3, KE3, S18, ribosomal protein S18
Зовнішні ІД OMIM: 180473 MGI: 98146 HomoloGene: 88764 GeneCards: RPS18
Онтологія гена
Молекулярна функція

• rRNA binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• nucleic acid binding
• RNA binding
• structural constituent of ribosome
• protein kinase binding

Клітинна компонента

• цитоплазма
• рибосома
• мембрана
• focal adhesion
• внутрішньоклітинний
• small ribosomal subunit
• екзосома
• клітинне ядро
• нуклеоплазма
• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• гіалоплазма
• cytosolic small ribosomal subunit
• GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення
• синапс

Біологічний процес

• viral transcription
• SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
• translational initiation
• nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
• Біосинтез білків
• ribosome biogenesis
• rRNA processing

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6222
20084
Ensembl
ENSG00000226225
ENSG00000096150
ENSG00000231500
ENSG00000235650
ENSG00000223367
ENSG00000227794
ENSMUSG00000008668
UniProt
P62269
P62270
RefSeq (мРНК)
NM_022551
NM_011296
NM_138946
RefSeq (білок)
NP_072045
NP_035426
Локус (UCSC) Хр. 6: 33.27 – 33.28 Mb Хр. 17: 34.17 – 34.17 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

RPS18 (англ. Ribosomal protein S18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 152 амінокислот, а молекулярна маса — 17 719[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSLVIPEKFQHILRVLNTNIDGRRKIAFAITAIKGVGRRYAHVVLRKADI
DLTKRAGELTEDEVERVITIMQNPRQYKIPDWFLNRQKDVKDGKYSQVLA
NGLDNKLREDLERLKKIRAHRGLRHFWGLRVRGQHTKTTGRRGRTVGVSK
KK

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК, рРНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

  • Chassin D., Bellet D., Koman A. (1993). The human homolog of ribosomal protein S18. Nucleic Acids Res. 21: 745—745. PMID 8441687 DOI:10.1093/nar/21.3.745
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10401 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, P62269 (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 6
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Біосинтез білків: трансляція (трансляція прокаріотів, трансляція еукаріотів)
Білки
Фактори ініціації трансляції
Фактори ініціації трансляції прокаріотів
  • PIF-1
  • PIF-2
  • PIF-3
Фактори ініціації трансляції археїв
  • aIF1
  • aIF2
  • aIF5
  • aIF6
Фактори ініціації трансляції еукаріотів
eIF1
eIF2
eIF3
eIF4
eIF5
eIF6
Фактори елонгації трансляції
Фактори елонгації трансляції прокаріотів
  • EF-Tu
  • EF-Ts
  • EF-G
Фактори елонгації трансляції археїв
  • aEF-1, aEF-2
Фактори елонгації трансляції еукаріотів
Фактори термінації трансляції
  • Фактори термінації трансляції прокаріотів
  • Фактори термінації трансляції археїв
  • Фактори термінації трансляції еукаріотів
Рибосомні білки
Цитоплазмові
підрозділ 60S
підрозділ 40S
Мітохондріальні
підрозділ 39S
підрозділ 28S