EIF4A3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2HXY, 2HYI, 2J0Q, 2J0S, 2J0U, 2XB2, 3EX7, 4C9B

Ідентифікатори

Символи

EIF4A3, DDX48, MUK34, NMP265, NUK34, RCPS, eIF4AIII, eukaryotic translation initiation factor 4A3, Fal1, eIF4A-III, eIF-4A-III

Зовнішні ІД

OMIM: 608546 MGI: 1923731 HomoloGene: 5602 GeneCards: EIF4A3

Пов'язані генетичні захворювання

Richieri Costa-Pereira syndrome^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • selenocysteine insertion sequence binding • GO:0008026 helicase activity • poly(A) binding • RNA stem-loop binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • ribonucleoprotein complex binding • hydrolase activity • ATP binding • mRNA binding • RNA binding • translation regulator activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • nuclear speck • catalytic step 2 spliceosome • мембрана • exon-exon junction complex • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерце • glutamatergic synapse • postsynaptic cytosol • Рибонуклеопротеїни • U2-type catalytic step 1 spliceosome
Біологічний процес	• nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • mRNA transport • negative regulation of translation • associative learning • GO:1904578 response to organic cyclic compound • regulation of mRNA binding • mRNA processing • positive regulation of translation • negative regulation of gene expression • negative regulation of excitatory postsynaptic potential • cellular response to brain-derived neurotrophic factor stimulus • cellular response to selenite ion • exploration behavior • RNA secondary structure unwinding • Сплайсинг РНК • rRNA processing • embryonic cranial skeleton morphogenesis • negative regulation of selenocysteine insertion sequence binding • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • regulation of translation • negative regulation of selenocysteine incorporation • mRNA splicing, via spliceosome • RNA export from nucleus • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA export from nucleus • mRNA 3'-end processing • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome • GO:0015915 транспорт • regulation of translation at postsynapse, modulating synaptic transmission
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9775


192170

Ensembl


ENSG00000141543


ENSMUSG00000025580

UniProt


P38919


Q91VC3

RefSeq (мРНК)


NM_014740


NM_138669

RefSeq (білок)


NP_055555


NP_619610

Локус (UCSC)

Хр. 17: 80.13 – 80.15 Mb

Хр. 11: 119.18 – 119.19 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

EIF4A3 (англ. Eukaryotic translation initiation factor 4A3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 411 амінокислот, а молекулярна маса — 46 871^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATTATMATS	GSARKRLLKE	EDMTKVEFET	SEEVDVTPTF	DTMGLREDLL
RGIYAYGFEK	PSAIQQRAIK	QIIKGRDVIA	QSQSGTGKTA	TFSISVLQCL
DIQVRETQAL	ILAPTRELAV	QIQKGLLALG	DYMNVQCHAC	IGGTNVGEDI
RKLDYGQHVV	AGTPGRVFDM	IRRRSLRTRA	IKMLVLDEAD	EMLNKGFKEQ
IYDVYRYLPP	ATQVVLISAT	LPHEILEMTN	KFMTDPIRIL	VKRDELTLEG
IKQFFVAVER	EEWKFDTLCD	LYDTLTITQA	VIFCNTKRKV	DWLTEKMREA
NFTVSSMHGD	MPQKERESIM	KEFRSGASRV	LISTDVWARG	LDVPQVSLII
NYDLPNNREL	YIHRIGRSGR	YGRKGVAINF	VKNDDIRILR	DIEQYYSTQI
DEMPMNVADL	I

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція трансляції, процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транспорт, процесинг рРНК, транспорт мРНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
Shibuya T., Tange T.O., Sonenberg N., Moore M.J. (2004). eIF4AIII binds spliced mRNA in the exon junction complex and is essential for nonsense-mediated decay. Nat. Struct. Mol. Biol. 11: 346—351. PMID 15034551 DOI:10.1038/nsmb750
Simmons H.M., Ruis B.L., Kapoor M., Hudacek A.W., Conklin K.F. (2005). Identification of NOM1, a nucleolar, eIF4A binding protein encoded within the chromosome 7q36 breakpoint region targeted in cases of pediatric acute myeloid leukemia. Gene. 347: 137—145. PMID 15715967 DOI:10.1016/j.gene.2004.12.027
Tange T.O., Shibuya T., Jurica M.S., Moore M.J. (2005). Biochemical analysis of the EJC reveals two new factors and a stable tetrameric protein core. RNA. 11: 1869—1883. PMID 16314458 DOI:10.1261/rna.2155905
Shibuya T., Tange T.O., Stroupe M.E., Moore M.J. (2006). Mutational analysis of human eIF4AIII identifies regions necessary for exon junction complex formation and nonsense-mediated mRNA decay. RNA. 12: 360—374. PMID 16495234 DOI:10.1261/rna.2190706

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з EIF4A3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18683 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 28 лютого 2017.
↑ UniProt, P38919 (англ.) . Архів оригіналу за 24 березня 2017. Процитовано 28 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 17

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Біосинтез білків: трансляція (трансляція прокаріотів, трансляція еукаріотів)

Білки

Фактори ініціації трансляції

Фактори ініціації трансляції прокаріотів

PIF-1
PIF-2
PIF-3

Фактори ініціації трансляції археїв

aIF1
aIF2
aIF5
aIF6

Фактори ініціації трансляції еукаріотів

eIF1	eIF1 AX AY B

eIF2	α β γ eIF2B 1 2 3 4 5 кіназа eIF2A eIF2D

eIF3	A B C D E F G H I J K L M

eIF4	EIF4A2 A3 B E1 E2 E3 G1 G2 G3 H

eIF5	EIF5 A A2 5B

eIF6	EIF6

Фактори елонгації трансляції

Фактори елонгації трансляції прокаріотів	EF-Tu EF-Ts EF-G

Фактори елонгації трансляції археїв	aEF-1, aEF-2

Фактори елонгації трансляції еукаріотів	EEF-1 A1 A2 A3 B1 B2 B3 B4 D E1 G EEF2

Фактори термінації трансляції

Фактори термінації трансляції прокаріотів
Фактори термінації трансляції археїв
Фактори термінації трансляції еукаріотів

Клас 1
- eRF1
Клас 2/RF3
- GSPT1
- GSPT2

Рибосомні білки

Цитоплазмові

підрозділ 60S	RPL3 4 5 6 7 7A 8 9 10 A L 11 12 13 13A 14 15 17 18 18A 19 21 22 23 23A 24 26 27 27A 28 29 30 31 32 34 35 35A 36 36A 37 37A 38 39 40 41 P0 P1 P2 RRP15 RSL24D1

підрозділ 40S	RPSA 2 3 3A RPS4 X Y1 Y2 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 15A 16 17 18 19 20 21 23 24 25 26 27 27A 28 29 30 RACK1

Мітохондріальні

підрозділ 39S	MRPL1 2 3 4 6 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58

підрозділ 28S	MRPS1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 14 15 16 17 18 A B C 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 33 34 35 36