Katalase

Katalase
Pengenal pasti
SimbolCatalase
PfamPF00199
InterProIPR011614
PROSITEPDOC00395
SCOP7cat
SUPERFAMILY7cat
Superkeluarga OPM370
Protein OPM3e4w
CDDcd00328
Struktur protein yang tersedia:
Pfamstruktur
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumringkasan struktur
Katalase
Pengenal pasti
Nombor EC1.11.1.6
Nombor CAS9001-05-2
Pangkalan data
IntEnzLihat IntEnz
BRENDAEntri BRENDA
ExPASyLihat NiceZyme
KEGGEntri KEGG
MetaCycLaluan metabolik
PRIAMProfil
Struktur PDBRCSB PDB
PDBj
PDBe
PDBsum
Ontologi genAmiGO / EGO
Gelintar
PMCRencana
PubMedRencana
NCBIProtein
Katalase
Struktur sedia ada
PDBPencarian ortolog: PDBe RCSB
Senarai kod PDB

1DGB, 1DGF, 1DGG, 1DGH, 1F4J, 1QQW

Pengecam
AliasCAT, catalase
Pengecam-pengecam luaranOMIM: 115500 MGI: 88271 HomoloGene: 55514 GeneCards: CAT
Kedudukan gen (Manusia)
Kromosom 11
Kr.Kromosom 11[1]
Kromosom 11
Kedudukan gen Katalase
Kedudukan gen Katalase
Jalur11p13Mula34,438,934 bp[1]
Tamat34,472,060 bp[1]
Corak ekspresi RNA
Bgee
HumanMouse (ortholog)
Top expressed in
  • trabecular bone

  • kidney tubule

  • renal medulla

  • mukosa jejunum

  • hati

  • Sumsum tulang

  • right lobe of liver

  • mucosa of ileum

  • skin of hip

  • skin of thigh
Top expressed in
  • left lobe of liver

  • darah

  • Tubul proksimal

  • tunica adventitia of aorta

  • right kidney

  • subcutaneous adipose tissue

  • stroma of bone marrow

  • brown adipose tissue

  • human kidney

  • intercostal muscle
More reference expression data
BioGPS


Rujukan lanjutan untuk data ekspresi
Ontologi gen
Fungsi molekul
  • protein homodimerization activity
  • aminoacylase activity
  • peroxidase activity
  • ikatan ion logam
  • oxidoreductase activity, acting on peroxide as acceptor
  • catalase activity
  • antioxidant activity
  • heme binding
  • NADP binding
  • enzyme binding
  • oxidoreductase activity
  • signaling receptor binding
  • identical protein binding
Komponen sel
  • cytosol
  • jasad Golgi
  • membran
  • intracellular membrane-bounded organelle
  • focal adhesion
  • mitochondrial intermembrane space
  • peroxisomal membrane
  • Peroksisom
  • Membran plasma
  • peroxisomal matrix
  • Jalinan endoplasma
  • Mitokondrion
  • Lisosom
  • extracellular exosome
  • extracellular region
  • Ekstrasel
  • secretory granule lumen
  • ficolin-1-rich granule lumen
Proses biologi
  • response to phenylpropanoid
  • ureteric bud development
  • response to estradiol
  • response to hypoxia
  • response to cadmium ion
  • response to fatty acid
  • kidney development
  • response to inactivity
  • response to hyperoxia
  • cellular response to growth factor stimulus
  • penuaan
  • cholesterol metabolic process
  • response to L-ascorbic acid
  • negative regulation of apoptotic process
  • response to ozone
  • response to oxidative stress
  • response to activity
  • protein tetramerization
  • response to vitamin E
  • response to insulin
  • response to vitamin A
  • aerobic respiration
  • response to lead ion
  • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
  • osteoblast differentiation
  • hydrogen peroxide catabolic process
  • UV protection
  • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling
  • response to radiation
  • response to light intensity
  • response to ethanol
  • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity
  • triglyceride metabolic process
  • protein homotetramerization
  • response to UV
  • response to toxic substance
  • response to hydrogen peroxide
  • hemoglobin metabolic process
  • positive regulation of cell division
  • cellular oxidant detoxification
  • neutrophil degranulation
  • response to reactive oxygen species
  • cellular response to oxidative stress
  • protein targeting to peroxisome
Sumber:Amigo / QuickGO
Ortolog
SpesiesManusiaMencit
Entrez

847

12359

Ensembl

ENSG00000121691

ENSMUSG00000027187

UniProt

P04040

P24270

RefSeq (mRNA)

NM_001752

NM_009804

RefSeq (protein)

NP_001743

NP_033934

Kedudukan (UCSC)Chr 11: 34.44 – 34.47 Mbtiada data
Carian PubMed[2][3]
Wikidata
Papar/Sunting data manusiaPapar/Sunting data mencit

Katalase merupakan enzim biasa yang terdapat pada hampir keseluruhan organisma hidup yang terdedah pada oksigen, di mana ia menjadi mangkin pada penguraian hidrogen peroksida kepada air dan oksigen.[4] Katalase memiliki salah satu jumlah pusing ganti bagi semua enzim; satu molekul katalase mampu menukar 40 juta molekul hidrogen peroksida pada air dan oksigen setiap saat.[5]

Katalase merupakan protin tetramer bagi empat rantaian polipeptida, setiap satu panjang melebihi 500 asid amino.[6] It contains four porphyrin heme (iron) groups that allow the enzyme to react with the hydrogen peroxide. The optimum pH for human catalase is approximately 7,[7] and has a fairly broad maximum (the rate of reaction does not change appreciably at pHs between 6.8 and 7.5).[8] The pH optimum for other catalases varies between 4 and 11 depending on the species.[9] The optimum temperature also varies by species.[10]

Sejarah

Katalase pertama kali disedari sebagai bahan pada tahun 1818 apabila Louis Jacques Thénard, yang menjumpai H2O2 (hidrogen peroksida), mencadangkan penguraiannya disebabkan oleh sejenis bahan. Pada tahun 1900, Oscar Loew merupakan orang yang pertama memberikannya nama katalase, dan mendapati kehadirannya pada kebanyakan tumbuhan dan haiwan.[11] In 1937 catalase from beef liver was crystallised by James B. Sumner[12] and the molecular weight was worked out in 1938.[13]

Pada tahun 1969, jujukan katalase asid amino bovin (lembu) diungkaikan.[14] Then in 1981, the 3D structure of the protein was revealed.[15]

Tindakan

Tindak balas katalase pada penguraian hidrogen peroksida adalah:

2 H2O2 → 2 H2O + O2

Kewujudan katalse pada contoh mikrobial atau tisu boleh diuji dengan menambah isipadu larutan enzim dan melihat tindak-balas. Pembentukan buih (oksigen) menunjukkan keputusan positif. Ini boleh berlaku kerana katalase memiliki aktiviti khusus amat tinggi, yang menghasilkan tindak-balas boleh dikesan.

Mekanisma molekul

Sungguhpun mekanisma lengkap katalase masih belum jelas sepenuhnya,[16] tindak balas kimia dipercayai berlaku pada dua tahap:

H2O2 + Fe(III)-E → H2O + O=Fe(IV)-E(.+)
H2O2 + O=Fe(IV)-E(.+) → H2O + Fe(III)-E + O2[16]
Di sini Fe()-E mewakili teras besi bagi kumpulan heme terikat pada enzim. Fe(IV)-E(.+) merupakan bentuk mesomerik bagi Fe(V)-E, bererti besi tidak teriksida sepenuhnya kepada +V tetapi menerima sebahagian "elektron sokongan" dari ligand heme. Heme ini perlu dikeluarkan kemudian sebagai kation radikal ("radical cation") (.+).

Apabila hidrogen peroksida memasuki tapak aktif, ia bertindak balas dengan Asn147 ("asparagine" asid amino pada kedudukan 147) dan His74, menyebabkan proton (ion hidrogen) berpindah antara ataom oksigen. Koordinat atom oksigen bebas, membebaskan molekul air yang baru terbentuk dan Fe(IV)=O. Fe(IV)=O bertindak balas dengan molekul hidrogen oksida kedua bagi membentuk Fe(III)-E dan menghasilkan air dan oksigen.[16] Kereaktifan teras besi boleh dipertingkat dengan kehadiran ligand fenol bagi Tyr357 pada ligand besi kelima, yang mampu membantu bagi pengoksidaan Fe(III) kepada Fe(IV). Keberkesanan tindak balas juga boleh dipertingkat dengan tindak balas His74 dan Asn147 dengan perantaraan tindak-balas.[16] In general, the rate of the reaction can be determined by the Michaelis-Menten equation.[17]

Katalase juga mampu mengoksida pelbagai toksin berlainan, seperti formaldehid, asid formik, fenol, dan alkohol. Untuk melakukannya, ia menggunakan hidrogen peroksida menurut tindak balas berikut:

H2O2 + H2R → 2H2O + R

Juga, mekanisma sebenar tindak-balas ini tidak diketahui.


Peranan dalam gangguan

The gangguan peroxisomal akatalasia adalah disebabkan kekurangan pada fungsi katalase. Polimorfisme genetik pada katalase dan perubahan ungkapannya dan aktivitinya dikaitkan dengan kerosakan DNA oksidaan dan selanjutnya risiko individual kepada kecenderungan barah.[18]

Interaksi

Katalase telah terbukti sebagai bertindak balas secara protin dengan ABL2[19] and Abl gene.[19]

Rujukan

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000121691 - Ensembl, May 2017
  2. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ Chelikani P, Fita I, Loewen PC (2004). "Diversity of structures and properties among catalases". Cell. Mol. Life Sci. 61 (2): 192–208. doi:10.1007/s00018-003-3206-5. PMID 14745498. Unknown parameter |month= ignored (bantuan)CS1 maint: multiple names: authors list (link)
  5. ^ Goodsell DS (2004-09-01). "Catalase". Molecule of the Month. RCSB Protein Data Bank. Diarkibkan daripada yang asal pada 2020-10-01. Dicapai pada 2007-02-11.
  6. ^ Boon EM, Downs A, Marcey D. "Catalase: H2O2: H2O2 Oxidoreductase". Catalase Structural Tutorial Text. Dicapai pada 2007-02-11.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
  7. ^ Maehly A, Chance B (1954). "The assay of catalases and peroxidases". Methods Biochem Anal. Methods of Biochemical Analysis. 1: 357–424. doi:10.1002/9780470110171.ch14. ISBN 9780470110171. PMID 13193536.
  8. ^ Aebi H (1984). Aebi, Hugo (penyunting). "Catalase in vitro". Meth. Enzymol. Methods in Enzymology. 105: 121–126. doi:10.1016/S0076-6879(84)05016-3. ISBN 012182005X. PMID 6727660.
  9. ^ "EC 1.11.1.6 - catalase". BRENDA: The Comprehensive Enzyme Information System. Department of Bioinformatics and Biochemistry, Technische Universität Braunschweig. Dicapai pada 2009-05-26. Cite has empty unknown parameter: |coauthors= (bantuan)
  10. ^ Toner K, Sojka G, Ellis R. "A Quantitative Enzyme Study; CATALASE". bucknell.edu. Diarkibkan daripada yang asal pada 2000-06-12. Dicapai pada 2007-02-11.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
  11. ^ Loew O (1900). "A New Enzyme of General Occurrence in Organisms". Science. 11 (279): 701–702. doi:10.1126/science.11.279.701. PMID 17751716. Unknown parameter |month= ignored (bantuan)
  12. ^ Sumner JB, Dounce AL (1937). "Crystalline catalase". Science. 85 (2206): 366–367. doi:10.1126/science.85.2206.366. PMID 17776781. Unknown parameter |month= ignored (bantuan)
  13. ^ Sumner JB, Gralén N (1938). "The molecular weight of crystalline catalase". Science. 87 (2256): 284–284. doi:10.1126/science.87.2256.284. PMID 17831682. Unknown parameter |month= ignored (bantuan)
  14. ^ Schroeder WA, Shelton JR, Shelton JB, Robberson B, Apell G (1969). "The amino acid sequence of bovine liver catalase: a preliminary report". Arch. Biochem. Biophys. 131 (2): 653–655. doi:10.1016/0003-9861(69)90441-X. PMID 4892021. Unknown parameter |month= ignored (bantuan)CS1 maint: multiple names: authors list (link)
  15. ^ Murthy MR, Reid TJ, Sicignano A, Tanaka N, Rossmann MG (1981). "Structure of beef liver catalase". J. Mol. Biol. 152 (2): 465–499. doi:10.1016/0022-2836(81)90254-0. PMID 7328661. Unknown parameter |month= ignored (bantuan)CS1 maint: multiple names: authors list (link)
  16. ^ a b c d Boon EM, Downs A, Marcey D. "Proposed Mechanism of Catalase". Catalase: H2O2: H2O2 Oxidoreductase: Catalase Structural Tutorial. Dicapai pada 2007-02-11.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
  17. ^ Maass E (1998-07-19). "How does the concentration of hydrogen peroxide affect the reaction". MadSci Network. Dicapai pada 009-03-02. Cite has empty unknown parameter: |coauthors= (bantuan); Check date values in: |accessdate= (bantuan)
  18. ^ Khan MA, Tania M, Zhang D, Chen H (2010). "Antioxidant enzymes and cancer". Chin J Cancer Res. 22 (2): 87–92. doi:10.1007/s11670-010-0087-7.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
  19. ^ a b Cao, Cheng (2003). "Catalase activity is regulated by c-Abl and Arg in the oxidative stress response". J. Biol. Chem. United States. 278 (32): 29667–29675. doi:10.1074/jbc.M301292200. ISSN 0021-9258. PMID 12777400. Unknown parameter |month= ignored (bantuan); Unknown parameter |coauthors= ignored (|author= suggested) (bantuan); Cite has empty unknown parameters: |laydate=, |laysummary=, dan |laysource= (bantuan)

Pautan luar

  • "GenAge entry for CAT (Homo sapiens)". Human Ageing Genomic Resources. Dicapai pada 2009-03-05. Cite has empty unknown parameter: |coauthors= (bantuan)
  • "Catalase". MadSci FAQ. madsci.org. Dicapai pada 2009-03-05. Cite has empty unknown parameter: |coauthors= (bantuan)
  • "Catalase and oxidase test video". Regnvm Prokaryotae. Dicapai pada 2009-03-05. Cite has empty unknown parameter: |coauthors= (bantuan)
  • "EC 1.11.1.6 - catalase". Brenda: The Comprehensive Enzyme Information System. Dicapai pada 2009-03-05. Cite has empty unknown parameter: |coauthors= (bantuan)
  • "PeroxiBase - The peroxidase database". Swiss Institute of Bioinformatics. Diarkibkan daripada yang asal pada 2008-10-13. Dicapai pada 2009-03-05. Cite has empty unknown parameter: |coauthors= (bantuan)
  • "Catalase Procedure". MicrobeID.com. Dicapai pada 2009-04-22. Cite has empty unknown parameter: |coauthors= (bantuan)

Templat:Peroksidase Templat:Enzim metabolisme peroksisom