HMGB2

HMGB2
معرفات
أسماء بديلة HMGB2, HMG2, high mobility group box 2
معرفات خارجية الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 163906 MGI: MGI:96157 HomoloGene: 37582 GeneCards: 3148
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية

• ربط دي إن إي
• protein domain specific binding
• ‏GO:0001131، ‏GO:0001151، ‏GO:0001130، ‏GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
• transcription factor binding
• non-sequence-specific DNA binding, bending
• single-stranded DNA binding
• damaged DNA binding
• ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني
• four-way junction DNA binding
• ‏GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
• RAGE receptor binding
• chemoattractant activity
• double-stranded DNA binding
• DNA binding, bending
• supercoiled DNA binding
• RNA binding
• ‏GO:0001105 transcription coactivator activity

مكونات خلوية

• سيتوبلازم
• بلازم نووي
• صبغي
• الفراغ خارج الخلية
• نوية
• perinuclear region of cytoplasm
• condensed chromosome
• نواة
• خارج خلوي
• ‏GO:0009327 protein-containing complex

عمليات حيوية

• DNA geometric change
• positive regulation of interferon-beta production
• nucleosome assembly
• DNA recombination
• تفكك الحمض النووي الريبوزي منقوص الأوكسجين التموتي
• male gonad development
• ‏GO:0009373 ضبط نسخ الدنا
• positive regulation of endothelial cell proliferation
• positive regulation of erythrocyte differentiation
• inflammatory response to antigenic stimulus
• immune system process
• ‏GO:0044324، ‏GO:0003256، ‏GO:1901213، ‏GO:0046019، ‏GO:0046020، ‏GO:1900094، ‏GO:0061216، ‏GO:0060994، ‏GO:1902064، ‏GO:0003258، ‏GO:0072212 ضبط النسخ انطلاقاً من محفز بوليميراز الرنا الثاني
• response to steroid hormone
• ‏GO:0031497، ‏GO:0006336، ‏GO:0034724، ‏GO:0001301، ‏GO:0007580، ‏GO:0034652، ‏GO:0010847 chromatin organization
• negative regulation of gene expression
• نسخ الدنا
• ‏GO:0060469، ‏GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
• انجذاب كيميائي
• response to lipopolysaccharide
• ‏GO:1901313 positive regulation of gene expression
• positive regulation of nuclease activity
• ‏GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium
• negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors
• تأشيب جسمي
• تكون الحيوانات المنوية
• positive regulation of innate immune response
• cell chemotaxis
• DNA ligation involved in DNA repair
• spermatid nucleus differentiation
• positive regulation of DNA binding
• مناعة فطرية
• ‏GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
• cellular response to lipopolysaccharide
• inflammatory response
• positive regulation of megakaryocyte differentiation
• regulation of neurogenesis
• regulation of stem cell proliferation
• DNA topological change
• ‏GO:0003257، ‏GO:0010735، ‏GO:1901228، ‏GO:1900622، ‏GO:1904488 ضبط زيادي للنسخ انطلاقا من محفز بوليميراز الرنا الثاني
• ‏GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium
• positive chemotaxis
• تغيير بنية الكروماتين

المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
أنواع الإنسان الفأر
أنتريه 3148 97165
Ensembl ENSG00000164104 ENSMUSG00000054717
يونيبروت

P26583

P30681

RefSeq (رنا مرسال.)

‏NM_001130688، ‏NM_001130689 NM_002129، ‏NM_001130688، ‏NM_001130689

‏NM_001363443، ‏NM_001363444، ‏NM_001363445 NM_008252، ‏NM_001363443، ‏NM_001363444، ‏NM_001363445

RefSeq (بروتين)

‏NP_001124161، ‏NP_002120 NP_001124160، ‏NP_001124161، ‏NP_002120

‏NP_001350372، ‏NP_001350373، ‏NP_001350374 NP_032278، ‏NP_001350372، ‏NP_001350373، ‏NP_001350374

الموقع (UCSC n/a Chr 8: 57.96 – 57.97 Mb
بحث ببمد [1] [2]
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنساناعرض/عدّل فأر

HMGB2‏ (High mobility group box 2) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين HMGB2 في الإنسان.[1][2]

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

المراجع

  1. ^ "Entrez Gene: HMGB2 high-mobility group box 2". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.
  2. ^ Majumdar A، Brown D، Kerby S، Rudzinski I، Polte T، Randhawa Z، Seidman MM (ديسمبر 1991). "Sequence of human HMG2 cDNA". Nucleic Acids Research. ج. 19 ع. 23: 6643. DOI:10.1093/nar/19.23.6643. PMC:329240. PMID:1754403.

قراءة متعمقة

  • Alexandre S، Li WW، Lee AS (ديسمبر 1992). "A human HMG2 cDNA with a novel 3'-untranslated region". Nucleic Acids Research. ج. 20 ع. 23: 6413. DOI:10.1093/nar/20.23.6413. PMC:334538. PMID:1475204.
  • Shirakawa H، Yoshida M (أبريل 1992). "Structure of a gene coding for human HMG2 protein". The Journal of Biological Chemistry. ج. 267 ع. 10: 6641–5. PMID:1551873.
  • Bernués J، Espel E، Querol E (مايو 1986). "Identification of the core-histone-binding domains of HMG1 and HMG2". Biochimica et Biophysica Acta. ج. 866 ع. 4: 242–51. DOI:10.1016/0167-4781(86)90049-7. PMID:3697355.
  • Zwilling S، König H، Wirth T (مارس 1995). "High mobility group protein 2 functionally interacts with the POU domains of octamer transcription factors". The EMBO Journal. ج. 14 ع. 6: 1198–208. PMC:398197. PMID:7720710.
  • Shykind BM، Kim J، Sharp PA (يونيو 1995). "Activation of the TFIID-TFIIA complex with HMG-2". Genes & Development. ج. 9 ع. 11: 1354–65. DOI:10.1101/gad.9.11.1354. PMID:7797075.
  • Paull TT، Haykinson MJ، Johnson RC (أغسطس 1993). "The nonspecific DNA-binding and -bending proteins HMG1 and HMG2 promote the assembly of complex nucleoprotein structures". Genes & Development. ج. 7 ع. 8: 1521–34. DOI:10.1101/gad.7.8.1521. PMID:8339930.
  • Wanschura S، Schoenmakers EF، Huysmans C، Bartnitzke S، Van de Ven WJ، Bullrdiek J (يناير 1996). "Mapping of the human HMG2 gene to 4q31". Genomics. ج. 31 ع. 2: 264–5. DOI:10.1006/geno.1996.0046. PMID:8824816.
  • Nagaki S، Yamamoto M، Yumoto Y، Shirakawa H، Yoshida M، Teraoka H (مايو 1998). "Non-histone chromosomal proteins HMG1 and 2 enhance ligation reaction of DNA double-strand breaks". Biochemical and Biophysical Research Communications. ج. 246 ع. 1: 137–41. DOI:10.1006/bbrc.1998.8589. PMID:9600082.
  • Boonyaratanakornkit V، Melvin V، Prendergast P، Altmann M، Ronfani L، Bianchi ME، Taraseviciene L، Nordeen SK، Allegretto EA، Edwards DP (أغسطس 1998). "High-mobility group chromatin proteins 1 and 2 functionally interact with steroid hormone receptors to enhance their DNA binding in vitro and transcriptional activity in mammalian cells". Molecular and Cellular Biology. ج. 18 ع. 8: 4471–87. DOI:10.1128/mcb.18.8.4471. PMC:109033. PMID:9671457.
  • Yumoto Y، Shirakawa H، Yoshida M، Suwa A، Watanabe F، Teraoka H (سبتمبر 1998). "High mobility group proteins 1 and 2 can function as DNA-binding regulatory components for DNA-dependent protein kinase in vitro". Journal of Biochemistry. ج. 124 ع. 3: 519–27. DOI:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022143. PMID:9722660.
  • Aidinis V، Bonaldi T، Beltrame M، Santagata S، Bianchi ME، Spanopoulou E (أكتوبر 1999). "The RAG1 homeodomain recruits HMG1 and HMG2 to facilitate recombination signal sequence binding and to enhance the intrinsic DNA-bending activity of RAG1-RAG2". Molecular and Cellular Biology. ج. 19 ع. 10: 6532–42. DOI:10.1128/mcb.19.10.6532. PMC:84623. PMID:10490593.
  • Butteroni C، De Felici M، Schöler HR، Pesce M (ديسمبر 2000). "Phage display screening reveals an association between germline-specific transcription factor Oct-4 and multiple cellular proteins". Journal of Molecular Biology. ج. 304 ع. 4: 529–40. DOI:10.1006/jmbi.2000.4238. PMID:11099378.
  • Stros M، Ozaki T، Bacikova A، Kageyama H، Nakagawara A (مارس 2002). "HMGB1 and HMGB2 cell-specifically down-regulate the p53- and p73-dependent sequence-specific transactivation from the human Bax gene promoter". The Journal of Biological Chemistry. ج. 277 ع. 9: 7157–64. DOI:10.1074/jbc.M110233200. PMID:11748232.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Fan Z، Beresford PJ، Zhang D، Lieberman J (أبريل 2002). "HMG2 interacts with the nucleosome assembly protein SET and is a target of the cytotoxic T-lymphocyte protease granzyme A". Molecular and Cellular Biology. ج. 22 ع. 8: 2810–20. DOI:10.1128/MCB.22.8.2810-2820.2002. PMC:133744. PMID:11909973.
  • Dubois T، Howell S، Zemlickova E، Aitken A (أبريل 2002). "Identification of casein kinase Ialpha interacting protein partners". FEBS Letters. ج. 517 ع. 1–3: 167–71. DOI:10.1016/S0014-5793(02)02614-5. PMID:12062430.
  • Fan Z، Beresford PJ، Zhang D، Xu Z، Novina CD، Yoshida A، Pommier Y، Lieberman J (فبراير 2003). "Cleaving the oxidative repair protein Ape1 enhances cell death mediated by granzyme A". Nature Immunology. ج. 4 ع. 2: 145–53. DOI:10.1038/ni885. PMID:12524539.
  • Lv X، Xu DD، Liu DP، Li L، Hao DL، Liang CC (2003). "High-mobility group protein 2 may be involved in the locus control region regulation of the beta-globin gene cluster". Biochemistry and Cell Biology = Biochimie Et Biologie Cellulaire. ج. 80 ع. 6: 765–70. DOI:10.1139/o02-164. PMID:12555809.
  • Pallier C، Scaffidi P، Chopineau-Proust S، Agresti A، Nordmann P، Bianchi ME، Marechal V (أغسطس 2003). "Association of chromatin proteins high mobility group box (HMGB) 1 and HMGB2 with mitotic chromosomes". Molecular Biology of the Cell. ج. 14 ع. 8: 3414–26. DOI:10.1091/mbc.E02-09-0581. PMC:181577. PMID:12925773.
  • Aird KM، Iwasaki O، Kossenkov AV، Tanizawa H، Fatkhutdinov N، Bitler BG، Le L، Alicea G، Yang TL، Johnson FB، Noma K، Zhang R (أكتوبر 2016). "HMGB2 orchestrates the chromatin landscape of senescence-associated secretory phenotype gene loci". JCB. DOI:10.1083/jcb.201608026. Loss of HMGB2 (High-mobility group protein box 2) during هرم (فيزيولوجيا) blunts SASP (senescence-associated secretory phenotype) جين expression by allowing for spreading of repressive كروماتين مغاير into SASP gene loci. This correlates with incorporation of SASP gene loci into SAHF (senescence-associated heterochromatin foci), which in turn represses SASP gene expression
معرفات كيميائية
  • ع
  • ن
  • ت
جينات الكروموسوم 4
جينات الكروموسوم 4
  • أيقونة بوابةبوابة الكيمياء الحيوية
  • أيقونة بوابةبوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
  • أيقونة بوابةبوابة طب
أيقونة بذرة

هذه بذرة مقالة عن جين على كروموسوم 4 بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

التصنيفات الطبية
المعرفات الخارجية