TLR6

TLR6
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4OM7

Ідентифікатори
Символи TLR6, CD286, toll like receptor 6
Зовнішні ІД OMIM: 605403 MGI: 1341296 HomoloGene: 21223 GeneCards: TLR6
Онтологія гена
Молекулярна функція

• Toll-like receptor 2 binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• transmembrane signaling receptor activity
• ліпопептидний зв'язок
• amyloid-beta binding
• signaling receptor binding
• signaling receptor activity
• identical protein binding
• protein heterodimerization activity

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• phagocytic vesicle membrane
• мембрана
• integral component of plasma membrane
• GO:0016023 cytoplasmic vesicle
• комплекс Ґольджі
• membrane raft
• Toll-like receptor 2-Toll-like receptor 6 protein complex
• клітинна мембрана
• внутрішньоклітинний
• receptor complex

Біологічний процес

• positive regulation of NLRP3 inflammasome complex assembly
• процес імунної системи
• positive regulation of JUN kinase activity
• cellular response to diacyl bacterial lipopeptide
• activation of NF-kappaB-inducing kinase activity
• toll-like receptor 6 signaling pathway
• defense response to bacterium
• positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
• inflammatory response
• toll-like receptor TLR6:TLR2 signaling pathway
• detection of diacyl bacterial lipopeptide
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• вроджений імунітет
• T-helper 1 type immune response
• MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway
• nitric oxide metabolic process
• response to bacterial lipoprotein
• microglial cell activation
• toll-like receptor signaling pathway
• cell activation
• GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь
• GO:1901313 positive regulation of gene expression
• negative regulation of toll-like receptor 2 signaling pathway
• TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway
• positive regulation of macrophage activation
• positive regulation of nitric oxide biosynthetic process
• positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
• cellular response to oxidised low-density lipoprotein particle stimulus
• positive regulation of cytokine production involved in inflammatory response
• positive regulation of oxidative stress-induced neuron death
• positive regulation of reactive oxygen species biosynthetic process
• cellular response to amyloid-beta

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
10333
21899
Ensembl
ENSG00000174130
ENSMUSG00000051498
UniProt
Q9Y2C9
Q9EPW9
RefSeq (мРНК)
NM_006068
NM_001394553
NM_011604
NM_001359180
NM_001384171
RefSeq (білок)
NP_006059
NP_035734
NP_001346109
NP_001371100
Локус (UCSC) Хр. 4: 38.82 – 38.86 Mb Хр. 5: 65.11 – 65.12 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TLR6 (англ. Toll like receptor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 796 амінокислот, а молекулярна маса — 91 880[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDL
PLKTKVLDMSQNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQ
DLEYLDLSHNQLQKISCHPIVSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNF
LGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRNYYIKENETESLQILNAKTLH
LVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIKLNDDNCQVFIKFLSELTRGST
LLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFTYS
KTTLKALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCPH
APSTFKFLNFTQNVFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTK
DMPSLEILDVSWNSLESGRHKENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPP
RIKVLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQELNVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVL
IIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELREFVKNIDQVSSE
VLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVLAV
TVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSE
HDSAWVKSELVPYLEKEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSYKSIF
VLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHK
LKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAAFNMKLTLVTENNDVKS

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Bulut Y., Faure E., Thomas L., Equils O., Arditi M. (2001). Cooperation of Toll-like receptor 2 and 6 for cellular activation by soluble tuberculosis factor and Borrelia burgdorferi outer surface protein A lipoprotein: role of Toll-interacting protein and IL-1 receptor signaling molecules in Toll-like receptor 2 signaling. J. Immunol. 167: 987—994. PMID 11441107 DOI:10.4049/jimmunol.167.2.987
  • Jang T.H., Park H.H. (2014). Crystal structure of TIR domain of TLR6 reveals novel dimeric interface of TIR-TIR interaction for toll-like receptor signaling pathway. J. Mol. Biol. 426: 3305—3313. PMID 25088687 DOI:10.1016/j.jmb.2014.07.024

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16711 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
  4. ↑ UniProt, Q9Y2C9 (англ.) . Архів оригіналу за 5 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 4
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350