SPO11

Ідентифікатори

Символи

SPO11, CT35, SPATA43, TOPVIA, initiator of meiotic double stranded breaks, SPO11 initiator of meiotic double stranded breaks, Meiotic recombination, Spo11, Meiotic_Spo11, IPR013048, Spo11, TOPOVIA

Зовнішні ІД

OMIM: 605114 MGI: 1349669 HomoloGene: 6059 GeneCards: SPO11

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • каталітична активність • hydrolase activity • ATP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • isomerase activity • GO:0003918 DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity • endodeoxyribonuclease activity, producing 3'-phosphomonoesters • DNA binding
Клітинна компонента	• хромосома • теломера • клітинне ядро • nuclear chromosome
Біологічний процес	• protein localization to chromosome • female gamete generation • meiotic telomere clustering • male meiosis I • DNA metabolic process • DNA catabolic process, endonucleolytic • Оогенез • homologous chromosome pairing at meiosis • GO:0007126 мейоз • synaptonemal complex assembly • Сперматогенез • spermatid development • ovarian follicle development • meiotic DNA double-strand break processing • meiotic DNA double-strand break formation • reciprocal meiotic recombination • double-strand break repair involved in meiotic recombination
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23626


26972

Ensembl


ENSG00000054796


ENSMUSG00000005883

UniProt


Q9Y5K1 Q5TCH6


Q9WTK8

RefSeq (мРНК)


NM_012444 NM_198265


NM_001083959 NM_001083960 NM_012046 NM_001305434

RefSeq (білок)


NP_036576 NP_937998


NP_001077428 NP_001077429 NP_001292363 NP_036176

Локус (UCSC)

Хр. 20: 57.33 – 57.34 Mb

Хр. 2: 172.82 – 172.84 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SPO11 (англ. SPO11, initiator of meiotic double stranded breaks) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 396 амінокислот, а молекулярна маса — 44 537^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAFAPMGPEA	SFFDVLDRHR	ESLLAALRRG	GREPPTGGSR	LASSSEVLAS
IENIIQDIIT	SLARNEAPAF	TIDNRSSWEN	IKFEDSVGLQ	MVSHCTTRKI
KSDSPKSAQK	FSLILKILSM	IYKLVQSNTY	ATKRDIYYTD	SQLFGNQTVV
DNIINDISCM	LKVSRRSLHI	LSTSKGLIAG	NLRYIEEDGT	KVNCTCGATA
VAVPSNIQGI	RNLVTDAKFV	LIVEKDATFQ	RLLDDNFCNK	LSPCIMITGK
GVPDLNTRLL	VKKLWDTFHV	PVFTLVDADP	HGIEIMCIYK	YGSMSMSFEA
HHLTVPAIRW	LGLLPSDLKR	LNVPKDSLIP	LTKRDQMKLD	SILRRPYVTC
QPFWRKEMEI	MADSKMKAEI	QALTFLSSDY	LSRVYLPNKL	KFGGWI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, ізомераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як мейоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, ДНК, іоном магнію. Локалізований у ядрі.

Література

Shannon M., Richardson L., Christian A., Handel M.A., Thelen M.P. (1999). Differential gene expression of mammalian SPO11/TOP6A homologs during meiosis. FEBS Lett. 462: 329—334. PMID 10622720 DOI:10.1016/S0014-5793(99)01546-X
Romanienko P.J., Camerini-Otero R.D. (1999). Cloning, characterization, and localization of mouse and human SPO11. Genomics. 61: 156—169. PMID 10534401 DOI:10.1006/geno.1999.5955
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11250 (англ.) . Архів оригіналу за 22 квітня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y5K1 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.