SIN3A |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/95/Protein_SIN3A_PDB_1g1e.png/250px-Protein_SIN3A_PDB_1g1e.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, SIN3 transcription regulator family member A, WITKOS |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607776 MGI: 107157 HomoloGene: 32124 GeneCards: SIN3A |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
chromosome 15q24 deletion syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • histone deacetylase activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • protein deacetylase activity • transcription factor binding • chromatin binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • GO:0032403 protein-containing complex binding |
---|
Клітинна компонента | • transcription regulator complex • transcription repressor complex • нуклеоплазма • ядерце • Хроматин • клітинне ядро • кінетохор • Sin3 complex • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of protein localization to nucleus • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to oxidative stress • ритмічний процес • cellular response to dopamine • response to methylglyoxal • negative regulation of circadian rhythm • regulation of hormone levels • GO:0010260 старіння людини • negative regulation of apoptotic process • in utero embryonic development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • protein deacetylation • реплікація ДНК • negative regulation of transcription regulatory region DNA binding • response to organonitrogen compound • hematopoietic progenitor cell differentiation • activation of innate immune response • positive regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • histone deacetylation • negative regulation of histone H3-K27 acetylation • cellular response to glucose stimulus • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of defense response to virus by host • regulation of lipid metabolic process • regulation of megakaryocyte differentiation • negative regulation of nucleic acid-templated transcription |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001145357 NM_001145358 NM_015477 |
| | NM_001110350 NM_001110351 NM_011378 NM_001357754 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001138829 NP_001138830 NP_056292 |
| | NP_001103820 NP_001103821 NP_035508 NP_001344683 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 15: 75.37 – 75.46 Mb | Хр. 9: 56.98 – 57.04 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SIN3A (англ. SIN3 transcription regulator family member A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 273 амінокислот, а молекулярна маса — 145 175[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MKRRLDDQES | | PVYAAQQRRI | | PGSTEAFPHQ | | HRVLAPAPPV | | YEAVSETMQS |
ATGIQYSVTP | | SYQVSAMPQS | | SGSHGPAIAA | | VHSSHHHPTA | | VQPHGGQVVQ |
SHAHPAPPVA | | PVQGQQQFQR | | LKVEDALSYL | | DQVKLQFGSQ | | PQVYNDFLDI |
MKEFKSQSID | | TPGVISRVSQ | | LFKGHPDLIM | | GFNTFLPPGY | | KIEVQTNDMV |
NVTTPGQVHQ | | IPTHGIQPQP | | QPPPQHPSQP | | SAQSAPAPAQ | | PAPQPPPAKV |
SKPSQLQAHT | | PASQQTPPLP | | PYASPRSPPV | | QPHTPVTISL | | GTAPSLQNNQ |
PVEFNHAINY | | VNKIKNRFQG | | QPDIYKAFLE | | ILHTYQKEQR | | NAKEAGGNYT |
PALTEQEVYA | | QVARLFKNQE | | DLLSEFGQFL | | PDANSSVLLS | | KTTAEKVDSV |
RNDHGGTVKK | | PQLNNKPQRP | | SQNGCQIRRH | | PTGTTPPVKK | | KPKLLNLKDS |
SMADASKHGG | | GTESLFFDKV | | RKALRSAEAY | | ENFLRCLVIF | | NQEVISRAEL |
VQLVSPFLGK | | FPELFNWFKN | | FLGYKESVHL | | ETYPKERATE | | GIAMEIDYAS |
CKRLGSSYRA | | LPKSYQQPKC | | TGRTPLCKEV | | LNDTWVSFPS | | WSEDSTFVSS |
KKTQYEEHIY | | RCEDERFELD | | VVLETNLATI | | RVLEAIQKKL | | SRLSAEEQAK |
FRLDNTLGGT | | SEVIHRKALQ | | RIYADKAADI | | IDGLRKNPSI | | AVPIVLKRLK |
MKEEEWREAQ | | RGFNKVWREQ | | NEKYYLKSLD | | HQGINFKQND | | TKVLRSKSLL |
NEIESIYDER | | QEQATEENAG | | VPVGPHLSLA | | YEDKQILEDA | | AALIIHHVKR |
QTGIQKEDKY | | KIKQIMHHFI | | PDLLFAQRGD | | LSDVEEEEEE | | EMDVDEATGA |
VKKHNGVGGS | | PPKSKLLFSN | | TAAQKLRGMD | | EVYNLFYVNN | | NWYIFMRLHQ |
ILCLRLLRIC | | SQAERQIEEE | | NREREWEREV | | LGIKRDKSDS | | PAIQLRLKEP |
MDVDVEDYYP | | AFLDMVRSLL | | DGNIDSSQYE | | DSLREMFTIH | | AYIAFTMDKL |
IQSIVRQLQH | | IVSDEICVQV | | TDLYLAENNN | | GATGGQLNTQ | | NSRSLLESTY |
QRKAEQLMSD | | ENCFKLMFIQ | | SQGQVQLTIE | | LLDTEEENSD | | DPVEAERWSD |
YVERYMNSDT | | TSPELREHLA | | QKPVFLPRNL | | RRIRKCQRGR | | EQQEKEGKEG |
NSKKTMENVD | | SLDKLECRFK | | LNSYKMVYVI | | KSEDYMYRRT | | ALLRAHQSHE |
RVSKRLHQRF | | QAWVDKWTKE | | HVPREMAAET | | SKWLMGEGLE | | GLVPCTTTCD |
TETLHFVSIN | | KYRVKYGTVF | | KAP |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, ацетилювання. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Mathur M., Tucker P.W., Samuels H.H. (2001). PSF is a novel corepressor that mediates its effect through Sin3A and the DNA binding domain of nuclear hormone receptors. Mol. Cell. Biol. 21: 2298—2311. PMID 11259580 DOI:10.1128/MCB.21.7.2298-2311.2001
- Yang X., Zhang F., Kudlow J.E. (2002). Recruitment of O-GlcNAc transferase to promoters by corepressor mSin3A: coupling protein O-GlcNAcylation to transcriptional repression. Cell. 110: 69—80. PMID 12150998 DOI:10.1016/S0092-8674(02)00810-3
- Wysocka J., Myers M.P., Laherty C.D., Eisenman R.N., Herr W. (2003). Human Sin3 deacetylase and trithorax-related Set1/Ash2 histone H3-K4 methyltransferase are tethered together selectively by the cell-proliferation factor HCF-1. Genes Dev. 17: 896—911. PMID 12670868 DOI:10.1101/gad.252103
- Fleischer T.C., Yun U.J., Ayer D.E. (2003). Identification and characterization of three new components of the mSin3A corepressor complex. Mol. Cell. Biol. 23: 3456—3467. PMID 12724404 DOI:10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003
- Nikolaev A.Y., Papanikolaou N.A., Li M., Qin J., Gu W. (2004). Identification of a novel BRMS1-homologue protein p40 as a component of the mSin3A/p33(ING1b)/HDAC1 deacetylase complex. Biochem. Biophys. Res. Commun. 323: 1216—1222. PMID 15451426 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.08.227
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SIN3A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19353 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96ST3 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |