HLA-F |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | HLA-F, CDA12, HLA-5.4, HLA-CDA12, major histocompatibility complex, class I, F |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 143110 MGI: 3647514 HomoloGene: 133121 GeneCards: HLA-F |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • TAP2 binding • TAP1 binding • signaling receptor binding • peptide antigen binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • beta-2-microglobulin binding • 14-3-3 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • phagocytic vesicle membrane • early endosome membrane • мембрана • Golgi membrane • клітинна мембрана • cell surface • ендоплазматичний ретикулум • MHC class I protein complex • ER to Golgi transport vesicle membrane • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane • recycling endosome membrane • міжклітинний простір • лізосома • lysosomal membrane • ендосома • external side of plasma membrane • MHC class Ib protein complex |
---|
Біологічний процес | • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • interferon-gamma-mediated signaling pathway • процес імунної системи • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-independent • type I interferon signaling pathway • regulation of immune response • positive regulation of T cell mediated cytotoxicity • antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class Ib • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class Ib • antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class I via ER pathway, TAP-independent • negative regulation of T cell cytokine production • negative regulation of natural killer cell cytokine production • positive regulation of natural killer cell cytokine production • negative regulation of natural killer cell degranulation • positive regulation of natural killer cell degranulation • negative regulation of natural killer cell mediated cytotoxicity • negative regulation of neuron death |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | ENSG00000229698 ENSG00000237508 ENSG00000234487 ENSG00000206509 ENSG00000137403
| ENSG00000235220 ENSG00000204642 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001098478 NM_001098479 NM_018950 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001091948 NP_001091949 NP_061823 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 29.72 – 29.74 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
HLA-F (англ. Major histocompatibility complex, class I, F) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 346 амінокислот, а молекулярна маса — 39 062[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAPRSLLLLL | | SGALALTDTW | | AGSHSLRYFS | | TAVSRPGRGE | | PRYIAVEYVD |
DTQFLRFDSD | | AAIPRMEPRE | | PWVEQEGPQY | | WEWTTGYAKA | | NAQTDRVALR |
NLLRRYNQSE | | AGSHTLQGMN | | GCDMGPDGRL | | LRGYHQHAYD | | GKDYISLNED |
LRSWTAADTV | | AQITQRFYEA | | EEYAEEFRTY | | LEGECLELLR | | RYLENGKETL |
QRADPPKAHV | | AHHPISDHEA | | TLRCWALGFY | | PAEITLTWQR | | DGEEQTQDTE |
LVETRPAGDG | | TFQKWAAVVV | | PPGEEQRYTC | | HVQHEGLPQP | | LILRWEQSPQ |
PTIPIVGIVA | | GLVVLGAVVT | | GAVVAAVMWR | | KKSSDRNRGS | | YSQAAV |
Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.
Література
- Geraghty D.E., Wei X., Orr H.T., Koller B.H. (1990). Human leukocyte antigen F (HLA-F). An expressed HLA gene composed of a class I coding sequence linked to a novel transcribed repetitive element. J. Exp. Med. 171: 1—18. PMID 1688605 DOI:10.1084/jem.171.1.1
- Lury D., Epstein H., Holmes N. (1990). The human class I MHC gene HLA-F is expressed in lymphocytes. Int. Immunol. 2: 531—537. PMID 1707659 DOI:10.1093/intimm/2.6.531
- He X., Xu L., Liu Y., Zeng Y. (2004). Identification of a novel HLA-F allele - HLA-F*010102. Tissue Antigens. 63: 181—183. PMID 14705989 DOI:10.1111/j.1399-0039.2004.00145.x
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4963 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P30511 (англ.) . Архів оригіналу за 11 жовтня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |