HLA-C

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3BZF,%%s4NT6,%%s1EFX,%%s1IM9, 1QQD

Ідентифікатори

Символи

HLA-C, D6S204, HLA-JY3, HLC-C, PSORS1, major histocompatibility complex, class I, C, MHC

Зовнішні ІД

OMIM: 142840 HomoloGene: 133080 GeneCards: HLA-C

Пов'язані генетичні захворювання

хронічне обструктивне захворювання легень, psoriatic arthritis^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptide antigen binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • phagocytic vesicle membrane • комплекс Ґольджі • early endosome membrane • мембрана • Golgi membrane • клітинна мембрана • cell surface • ендоплазматичний ретикулум • MHC class I protein complex • ER to Golgi transport vesicle membrane • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane • екзосома • secretory granule membrane • recycling endosome membrane
Біологічний процес	• antigen processing and presentation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • процес імунної системи • interferon-gamma-mediated signaling pathway • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-independent • type I interferon signaling pathway • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • regulation of immune response • GO:0022415 viral process • neutrophil degranulation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3107


н/д

Ensembl

ENSG00000204525 ENSG00000233841 ENSG00000228299 ENSG00000225691 ENSG00000206435
ENSG00000237022 ENSG00000206452


н/д

UniProt


P10321


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_002117 NM_001243042


н/д

RefSeq (білок)


NP_001229971 NP_002108


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 6: 31.27 – 31.27 Mb

н/д

PubMed search

^[2]

н/д

Вікідані

Див./Ред. для людей

HLA-C (англ. Major histocompatibility complex, class I, C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 366 амінокислот, а молекулярна маса — 40 649^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRVMAPRALL	LLLSGGLALT	ETWACSHSMR	YFDTAVSRPG	RGEPRFISVG
YVDDTQFVRF	DSDAASPRGE	PRAPWVEQEG	PEYWDRETQK	YKRQAQADRV
SLRNLRGYYN	QSEDGSHTLQ	RMSGCDLGPD	GRLLRGYDQS	AYDGKDYIAL
NEDLRSWTAA	DTAAQITQRK	LEAARAAEQL	RAYLEGTCVE	WLRRYLENGK
ETLQRAEPPK	THVTHHPLSD	HEATLRCWAL	GFYPAEITLT	WQRDGEDQTQ
DTELVETRPA	GDGTFQKWAA	VVVPSGQEQR	YTCHMQHEGL	QEPLTLSWEP
SSQPTIPIMG	IVAGLAVLVV	LAVLGAVVTA	MMCRRKSSGG	KGGSCSQAAC
SNSAQGSDES	LITCKA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у мембрані.

Література

Vilches C., Bunce M., de Pablo R., Herrero M.J., Kreisler M. (1995). Anchored PCR cloning of the novel HLA-Cw*0704 allele detected by PCR-SSP. Tissue Antigens. 46: 19—23. PMID 7482492 DOI:10.1111/j.1399-0039.1995.tb02471.x
Cooper S.L., Adams E.J., Wells R.S., Walker C.M., Parham P. (1998). A major histocompatibility complex class I allele shared by two species of chimpanzee. Immunogenetics. 47: 212—217. PMID 9435339 DOI:10.1007/s002510050350
Baurain J.-F., Coulie P.G. (1999). Correction of HLA-Cw*0501 and identification of HLA-Cw*0711. Tissue Antigens. 53: 510—512. PMID 10372547 DOI:10.1034/j.1399-0039.1999.530508.x
Steinle A., Schendel D.J. (1994). HLA class I alleles of LCL 721 and 174 x CEM.T2 (T2). Tissue Antigens. 44: 268—270. PMID 7871529 DOI:10.1111/j.1399-0039.1994.tb02394.x
van der Vlies S.A., Voorter C.E., van den Berg-Loonen E.M. (1999). There is more to HLA -C than exons 2 and 3: sequencing exons 1, 4 and 5. Tissue Antigens. 54: 169—177. PMID 10488744 DOI:10.1034/j.1399-0039.1999.540208.x
Pohla H., Kuon W., Tabaczewski P., Doerner C., Weiss E.H. (1989). Allelic variation in HLA-B and HLA-C sequences and the evolution of the HLA-B alleles. Immunogenetics. 29: 297—307. PMID 2714852 DOI:10.1007/BF00352839

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з HLA-C переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4933 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, P10321 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.