DROSHA

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2KHX, 5B16

Ідентифікатори

Символи

DROSHA, ETOHI2, HSA242976, RANSE3L, RN3, RNASE3L, RNASEN, drosha ribonuclease III

Зовнішні ІД

OMIM: 608828 MGI: 1261425 HomoloGene: 8293 GeneCards: DROSHA

Онтологія гена
Молекулярна функція	• ribonuclease III activity • protein homodimerization activity • lipopolysaccharide binding • зв'язування з іоном металу • endoribonuclease activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclease activity • endonuclease activity • hydrolase activity • RNA binding • DEAD/H-box RNA helicase binding • SMAD binding • R-SMAD binding • primary miRNA binding • double-stranded RNA binding
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • microprocessor complex • ядерце • клітинне ядро • клітинна мембрана • focal adhesion • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення
Біологічний процес	• GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • ribosome biogenesis • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • rRNA catabolic process • GO:1901313 positive regulation of gene expression • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium • regulation of miRNA metabolic process • GO:1990744, GO:1990729 primary miRNA processing • регуляція експресії генів • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • regulation of regulatory T cell differentiation • RNA phosphodiester bond hydrolysis • regulation of inflammatory response • GO:0061715 miRNA metabolic process • Сайленсинг генів • GO:0070919 production of siRNA involved in RNA interference • pre-miRNA processing
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


29102


14000

Ensembl


ENSG00000113360


ENSMUSG00000022191

UniProt


Q9NRR4


Q5HZJ0

RefSeq (мРНК)


NM_001100412 NM_013235 NM_001382508


NM_001130149 NM_026799

RefSeq (білок)


NP_001093882 NP_037367 NP_001369437


NP_001123621 NP_081075

Локус (UCSC)

Хр. 5: 31.4 – 31.53 Mb

Хр. 15: 12.82 – 12.94 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DROSHA (англ. Drosha ribonuclease III) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 374 амінокислот, а молекулярна маса — 159 316^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMQGNTCHRM	SFHPGRGCPR	GRGGHGARPS	APSFRPQNLR	LLHPQQPPVQ
YQYEPPSAPS	TTFSNSPAPN	FLPPRPDFVP	FPPPMPPSAQ	GPLPPCPIRP
PFPNHQMRHP	FPVPPCFPPM	PPPMPCPNNP	PVPGAPPGQG	TFPFMMPPPS
MPHPPPPPVM	PQQVNYQYPP	GYSHHNFPPP	SFNSFQNNPS	SFLPSANNSS
SPHFRHLPPY	PLPKAPSERR	SPERLKHYDD	HRHRDHSHGR	GERHRSLDRR
ERGRSPDRRR	QDSRYRSDYD	RGRTPSRHRS	YERSRERERE	RHRHRDNRRS
PSLERSYKKE	YKRSGRSYGL	SVVPEPAGCT	PELPGEIIKN	TDSWAPPLEI
VNHRSPSREK	KRARWEEEKD	RWSDNQSSGK	DKNYTSIKEK	EPEETMPDKN
EEEEEELLKP	VWIRCTHSEN	YYSSDPMDQV	GDSTVVGTSR	LRDLYDKFEE
ELGSRQEKAK	AARPPWEPPK	TKLDEDLESS	SESECESDED	STCSSSSDSE
VFDVIAEIKR	KKAHPDRLHD	ELWYNDPGQM	NDGPLCKCSA	KARRTGIRHS
IYPGEEAIKP	CRPMTNNAGR	LFHYRITVSP	PTNFLTDRPT	VIEYDDHEYI
FEGFSMFAHA	PLTNIPLCKV	IRFNIDYTIH	FIEEMMPENF	CVKGLELFSL
FLFRDILELY	DWNLKGPLFE	DSPPCCPRFH	FMPRFVRFLP	DGGKEVLSMH
QILLYLLRCS	KALVPEEEIA	NMLQWEELEW	QKYAEECKGM	IVTNPGTKPS
SVRIDQLDRE	QFNPDVITFP	IIVHFGIRPA	QLSYAGDPQY	QKLWKSYVKL
RHLLANSPKV	KQTDKQKLAQ	REEALQKIRQ	KNTMRREVTV	ELSSQGFWKT
GIRSDVCQHA	MMLPVLTHHI	RYHQCLMHLD	KLIGYTFQDR	CLLQLAMTHP
SHHLNFGMNP	DHARNSLSNC	GIRQPKYGDR	KVHHMHMRKK	GINTLINIMS
RLGQDDPTPS	RINHNERLEF	LGDAVVEFLT	SVHLYYLFPS	LEEGGLATYR
TAIVQNQHLA	MLAKKLELDR	FMLYAHGPDL	CRESDLRHAM	ANCFEALIGA
VYLEGSLEEA	KQLFGRLLFN	DPDLREVWLN	YPLHPLQLQE	PNTDRQLIET
SPVLQKLTEF	EEAIGVIFTH	VRLLARAFTL	RTVGFNHLTL	GHNQRMEFLG
DSIMQLVATE	YLFIHFPDHH	EGHLTLLRSS	LVNNRTQAKV	AEELGMQEYA
ITNDKTKRPV	ALRTKTLADL	LESFIAALYI	DKDLEYVHTF	MNVCFFPRLK
EFILNQDWND	PKSQLQQCCL	TLRTEGKEPD	IPLYKTLQTV	GPSHARTYTV
AVYFKGERIG	CGKGPSIQQA	EMGAAMDALE	KYNFPQMAHQ	KRFIERKYRQ
ELKEMRWERE	HQEREPDETE	DIKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

DROSHA за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез рибосом, РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію, РНК, іоном марганцю. Локалізований у ядрі.

Література

Wu H., Xu H., Miraglia L.J., Crooke S.T. (2000). Human RNase III is a 160-kDa protein involved in preribosomal RNA processing. J. Biol. Chem. 275: 36957—36965. PMID 10948199 DOI:10.1074/jbc.M005494200
Gunther M., Laithier M., Brison O. (2000). A set of proteins interacting with transcription factor Sp1 identified in a two-hybrid screening. Mol. Cell. Biochem. 210: 131—142. PMID 10976766 DOI:10.1023/A:1007177623283
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Landthaler M., Yalcin A., Tuschl T. (2004). The human DiGeorge syndrome critical region gene 8 and its D. melanogaster homolog are required for miRNA biogenesis. Curr. Biol. 14: 2162—2167. PMID 15589161 DOI:10.1016/j.cub.2004.11.001
Zeng Y., Yi R., Cullen B.R. (2005). Recognition and cleavage of primary microRNA precursors by the nuclear processing enzyme Drosha. EMBO J. 24: 138—148. PMID 15565168 DOI:10.1038/sj.emboj.7600491
Faller M., Matsunaga M., Yin S., Loo J.A., Guo F. (2007). Heme is involved in microRNA processing. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 23—29. PMID 17159994 DOI:10.1038/nsmb1182

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17904 (англ.) . Архів оригіналу за 9 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NRR4 (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.