CDH10

Ідентифікатори

Символи

CDH10, cadherin 10

Зовнішні ІД

OMIM: 604555 MGI: 107436 HomoloGene: 68530 GeneCards: CDH10

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse • integral component of presynaptic active zone membrane • integral component of postsynaptic specialization membrane • cell surface • catenin complex
Біологічний процес	• адгезія клітин • adherens junction organization • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell adhesion • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • GO:0000767 cell morphogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1008


320873

Ensembl


ENSG00000040731


ENSMUSG00000022321

UniProt


Q9Y6N8


P70408

RefSeq (мРНК)


NM_001190450 NM_006727 NM_001317222 NM_001317224 NM_001362460


NM_009865 NM_001316758

RefSeq (білок)


NP_001304151 NP_001304153 NP_006718 NP_001349389 NP_001304153.1


NP_001303687 NP_033995

Локус (UCSC)

Хр. 5: 24.49 – 24.64 Mb

Хр. 15: 18.82 – 19.01 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDH10 (англ. Cadherin 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 788 амінокислот, а молекулярна маса — 88 451^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTIHQFLLLF	LFWVCLPHFC	SPEIMFRRTP	VPQQRILSSR	VPRSDGKILH
RQKRGWMWNQ	FFLLEEYTGS	DYQYVGKLHS	DQDKGDGSLK	YILSGDGAGT
LFIIDEKTGD	IHATRRIDRE	EKAFYTLRAQ	AINRRTLRPV	EPESEFVIKI
HDINDNEPTF	PEEIYTASVP	EMSVVGTSVV	QVTATDADDP	SYGNSARVIY
SILQGQPYFS	VEPETGIIRT	ALPNMNRENR	EQYQVVIQAK	DMGGQMGGLS
GTTTVNITLT	DVNDNPPRFP	QNTIHLRVLE	SSPVGTAIGS	VKATDADTGK
NAEVEYRIID	GDGTDMFDIV	TEKDTQEGII	TVKKPLDYES	RRLYTLKVEA
ENTHVDPRFY	YLGPFKDTTI	VKISIEDVDE	PPVFSRSSYL	FEVHEDIEVG
TIIGTVMARD	PDSISSPIRF	SLDRHTDLDR	IFNIHSGNGS	LYTSKPLDRE
LSQWHNLTVI	AAEINNPKET	TRVAVFVRIL	DVNDNAPQFA	VFYDTFVCEN
ARPGQLIQTI	SAVDKDDPLG	GQKFFFSLAA	VNPNFTVQDN	EDNTARILTR
KNGFNRHEIS	TYLLPVVISD	NDYPIQSSTG	TLTIRVCACD	SQGNMQSCSA
EALLLPAGLS	TGALIAILLC	IIILLVIVVL	FAALKRQRKK	EPLILSKEDI
RDNIVSYNDE	GGGEEDTQAF	DIGTLRNPAA	IEEKKLRRDI	IPETLFIPRR
TPTAPDNTDV	RDFINERLKE	HDLDPTAPPY	DSLATYAYEG	NDSIAESLSS
LESGTTEGDQ	NYDYLREWGP	RFNKLAEMYG	GGESDKDS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Kools P., Vanhalst K., van den Eynde E., van Roy F. (1999). The human cadherin-10 gene: complete coding sequence, predominant expression in the brain, and mapping on chromosome 5p13-14. FEBS Lett. 452: 328—334. PMID 10386616 DOI:10.1016/S0014-5793(99)00672-9
Shimoyama Y., Tsujimoto G., Kitajima M., Natori M. (2000). Identification of three human type-II classic cadherins and frequent heterophilic interactions between different subclasses of type-II classic cadherins. Biochem. J. 349: 159—167. PMID 10861224 DOI:10.1042/0264-6021:3490159

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1749 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9Y6N8 (англ.) . Архів оригіналу за 27 серпня 2016. Процитовано 31 серпня 2017.