National Center for Biotechnology Information (NCBI)[1][2] face parte din Biblioteca Națională de Medicină a Statelor Unite (NLM), o ramură a Institutelor Naționale de Sănătate (NIH). Acesta este aprobat și finanțat de guvernul Statelor Unite. NCBI este situat în Bethesda, Maryland și a fost fondată în 1988 prin legislația sponsorizată de senatorul Claude Pepper.
NCBI găzduiește o serie de baze de date relevante pentru biotehnologie și biomedicină și reprezintă o resursă importantă pentru instrumentele și serviciile de bioinformatică. Bazele de date majore includ GenBank pentru secvențele de ADN și PubMed, o bază de date bibliografică pentru literatura biomedicală. Alte baze de date includ baza de date NCBI Epigenomics . Toate aceste baze de date sunt disponibile online prin intermediul motorului de căutare Entrez. NCBI a fost regizat de David Lipman,[2] unul dintre autorii originali ai BLAST secvența de aliniere program[3] și o figură respectată pe scară largă în bioinformatică. El a condus, de asemenea, un program de cercetare intramural, inclusiv grupuri conduse de Stephen Altschul (un alt coautor BLAST), David Landsman, Eugene Koonin, John Wilbur, Teresa Przytycka și Zhiyong Lu. David Lipman s-a remarcat în mai 2017.[4]
^ ab„Research Institute Posts Gene Data on Internet”. The New York Times. .
^„Sense from Sequences: Stephen F. Altschul on Bettering BLAST”. . Arhivat din original la .
^„National Library of Medicine Announces Departure of NCBI Director Dr. David Lipman”. www.nlm.nih.gov. Accesat în .
Legături externe
Wikidata are proprietatea:
NCBI taxonomy ID (P685) (vezi utilizări)
Site web oficial
National Library of Medicine
National Institutes of Health
v
d
m
Bioinformatică
Databases
Baze de date secvențiale: GenBank, European Nucleotide Archive și DNA Data Bank of Japan
Baze de date secundare: UniProt, baza de date a secvențelor de proteine care se grupează Swiss-Prot, TrEMBL și Protein Information Resource
Alte baze de date: Protein Data Bank, Proiectul bazei de date a genomului Ensembl și InterPro
Baze de date genomice specializate: BOLD, Saccharomyces Genome Database, FlyBase, VectorBase, WormBase, Rat Genome Database, PHI-base, Arabidopsis Information Resource și Zebrafish Information Network
Software
BLAST
Bowtie
Clustal
EMBOSS
HMMER
MUSCLE
SAMtools
SOAP suite
TopHat
Altele
Server: ExPASy
Ontology: Gene Ontology
Rosalind (education platform)
Instituții
Broad Institute
China National GeneBank (CNGB)
Computational Biology Department (CBD)
Microsoft Research - University of Trento Centre for Computational and Systems Biology (COSBI)
Database Center for Life Science (DBCLS)
DNA Data Bank of Japan (DDBJ)
European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI)
European Molecular Biology Laboratory (EMBL)
Flatiron Institute
J. Craig Venter Institute (JCVI)
Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics (MPI-CBG)
US National Center for Biotechnology Information (NCBI)
Japanese Institute of Genetics
Netherlands Bioinformatics Centre (NBIC)
Philippine Genome Center (PGC)
Scripps Research
Swiss Institute of Bioinformatics (SIB)
Wellcome Sanger Institute
Whitehead Institute
Organizații
African Society for Bioinformatics and Computational Biology (ASBCB)
Australia Bioinformatics Resource (EMBL-AR)
European Molecular Biology network (EMBnet)
International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC)
International Society for Biocuration (ISB)
International Society for Computational Biology (ISCB)
Student Council (ISCB-SC)
Institute of Genomics and Integrative Biology (CSIR-IGIB)
Japanese Society for Bioinformatics (JSBi)
Întâlniri
Basel Computational Biology Conference ([BC2])
European Conference on Computational Biology (ECCB)
Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB)
International Conference on Bioinformatics (InCoB)
ISCB Africa ASBCB Conference on Bioinformatics
Pacific Symposium on Biocomputing (PSB)
Research in Computational Molecular Biology (RECOMB)
