la première voit les trente-six équipes participantes réparties en deux poules (Est et Ouest) où elles s'affrontent deux fois au cours de la saison, à domicile et à l'extérieur. À l'issue de cette phase, les quatre premiers se qualifient pour le Super Huit.
le Super Huit est disputée avec deux poules de quatre équipes, qui ne s'affrontent qu'une seule fois. Les deux premiers de chaque groupe joue la phase finale.
la phase finale est disputée sous forme de matchs à élimination directe (demi-finales et finale sur un seul match).
C'est le club de Sriwijaya FC qui remporte le championnat cette saison après avoir battu lors de la finale nationale PSMS Medan. C'est le tout premier titre de champion d'Indonésie de l'histoire du club, qui réussit même le doublé en s'imposant en finale de la Coupe d'Indonésie face à Persipura Jayapura.
Cette saison est la dernière disputée sous cette forme. La saison suivante voit la mise en place de l'Indonesia Super League, avec une poule unique de dix-huit équipes. Afin de permettre la réduction du nombre d'engagés, seuls les neuf premiers de chaque poule de première phase se maintiennent, les autres clubs sont reversés en Divisi Utama, la nouvelle deuxième division indonésienne.
À la suite d'émeutes ayant eu lieu durant la demi-finale opposant Persipura Jayapura et PSMS Medan (au cours desquelles un supporter a trouvé la mort), la fédération indonésienne décide de reporter la finale du 9 au et de faire disputer la rencontre à huis clos.
↑En raison de la réforme du championnat pour la saison suivante, qui entraîne son rallongement cette saison jusqu'en février 2008, les clubs indonésiens ne sont pas autorisés à participer à la Ligue des champions de l'AFC 2008. Ils se qualifient en revanche pour l'édition 2009 de la Ligue des champions.
Un championnat parallèle (Indonesian Super League) est créé entre 2011 et 2013, en marge du seul championnat officiellement reconnu, l'Indonesian Premier League. Le championnat est abandonné lors de la saison 2015.
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Championnats nationaux de première division 2006-2007 à travers le monde